More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2157 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  100 
 
 
431 aa  860    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  51.97 
 
 
435 aa  450  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  51.4 
 
 
443 aa  449  1e-125  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1498  trigger factor  51.05 
 
 
441 aa  444  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  51.29 
 
 
444 aa  428  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  50.59 
 
 
444 aa  424  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  49.88 
 
 
439 aa  411  1e-113  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  45.92 
 
 
437 aa  397  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  45.09 
 
 
433 aa  373  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  36.63 
 
 
425 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  36.63 
 
 
425 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  36.63 
 
 
425 aa  189  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  36.63 
 
 
425 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  36.63 
 
 
425 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  36.63 
 
 
425 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  36.34 
 
 
425 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30.11 
 
 
436 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  36.05 
 
 
427 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.88 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  36.05 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  36.05 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  35.66 
 
 
428 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  37.95 
 
 
428 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  32.91 
 
 
439 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  35.76 
 
 
425 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  32.16 
 
 
433 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  31.07 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.78 
 
 
448 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  33.17 
 
 
439 aa  173  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  34.84 
 
 
433 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  28.6 
 
 
445 aa  172  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.95 
 
 
435 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.87 
 
 
435 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  33.33 
 
 
428 aa  170  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  28.51 
 
 
444 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  28.67 
 
 
436 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.78 
 
 
442 aa  166  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  29.33 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  28.44 
 
 
433 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  31.2 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.94 
 
 
434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  31.83 
 
 
431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  28.97 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  28.97 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  28.97 
 
 
434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  29.83 
 
 
434 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  27.42 
 
 
435 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  29.34 
 
 
434 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  30.24 
 
 
432 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30.07 
 
 
434 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  33.06 
 
 
436 aa  160  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  27.87 
 
 
450 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  27.88 
 
 
434 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  30 
 
 
432 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  28.13 
 
 
435 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  34.38 
 
 
433 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  29.27 
 
 
435 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  34.38 
 
 
433 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  33.14 
 
 
424 aa  159  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  30 
 
 
432 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.27 
 
 
435 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  27.31 
 
 
434 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  30.17 
 
 
430 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  30.32 
 
 
434 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  26.34 
 
 
436 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.87 
 
 
435 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  30.24 
 
 
432 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  28.75 
 
 
434 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  27.19 
 
 
435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  28.94 
 
 
551 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  28.64 
 
 
434 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  29.44 
 
 
427 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  32.08 
 
 
427 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  28.33 
 
 
432 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  26.82 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  33.16 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  30.17 
 
 
435 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.09 
 
 
432 aa  154  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  30 
 
 
443 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  29.18 
 
 
494 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  27.85 
 
 
447 aa  153  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  32.89 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  27.48 
 
 
452 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  29.76 
 
 
443 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  32.21 
 
 
432 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  28.8 
 
 
512 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  29.46 
 
 
438 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  27.17 
 
 
447 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  27.83 
 
 
434 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  29.51 
 
 
436 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>