More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0594 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  100 
 
 		 551 aa  1097    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  68.11 
 
 		 544 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  62.7 
 
 		 513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  44.12 
 
 		 512 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  44.27 
 
 		 518 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  46.01 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  41.91 
 
 		 440 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  41.19 
 
 		 463 aa  347  4e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  40.41 
 
 		 494 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  41.76 
 
 		 452 aa  346  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  41.91 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  40.45 
 
 		 495 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  41.57 
 
 		 443 aa  342  9e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  41.31 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  42.63 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  40.63 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  40.85 
 
 		 452 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  39.95 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  44.49 
 
 		 459 aa  333  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  39.07 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  41.96 
 
 		 452 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  37.22 
 
 		 474 aa  329  7e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  40.57 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  40.44 
 
 		 453 aa  329  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  39.74 
 
 		 491 aa  329  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  41.09 
 
 		 454 aa  327  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  39.33 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  39.73 
 
 		 453 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  40.81 
 
 		 444 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  37.81 
 
 		 453 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  39.1 
 
 		 485 aa  312  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  37.22 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  37.22 
 
 		 478 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  40.58 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  37.09 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  40.58 
 
 		 444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  37.17 
 
 		 473 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  37.42 
 
 		 473 aa  310  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  38.2 
 
 		 485 aa  306  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  38.2 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  36.12 
 
 		 485 aa  299  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  32.94 
 
 		 435 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  34.09 
 
 		 436 aa  236  8e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  32.81 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  33.03 
 
 		 436 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  32.58 
 
 		 437 aa  231  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  31.76 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.56 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  31.76 
 
 		 436 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  32.57 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  32.49 
 
 		 437 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  31.53 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  31.81 
 
 		 443 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  31.58 
 
 		 437 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  31.12 
 
 		 436 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  31.58 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.96 
 
 		 434 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  31.83 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  30.82 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  30.82 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  30.82 
 
 		 432 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  31.12 
 
 		 436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  30.82 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  30.82 
 
 		 432 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  30.84 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  31.12 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  31.42 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  31.19 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  30.96 
 
 		 435 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  30.98 
 
 		 432 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  215  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  31.35 
 
 		 436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  30.75 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  30.75 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  30.75 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  30.75 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  30.75 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  30.75 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  30.75 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  32.49 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.91 
 
 		 434 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.88 
 
 		 434 aa  213  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  29.14 
 
 		 445 aa  213  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.59 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  32.6 
 
 		 447 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  30.52 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  29.06 
 
 		 443 aa  211  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30 
 
 		 436 aa  211  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  30.59 
 
 		 434 aa  210  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  30.59 
 
 		 434 aa  210  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  31.78 
 
 		 437 aa  210  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  30.59 
 
 		 434 aa  210  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  31.58 
 
 		 436 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  31.58 
 
 		 436 aa  209  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  31.35 
 
 		 436 aa  209  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  31.59 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  32.39 
 
 		 447 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  31.13 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  30.57 
 
 		 432 aa  209  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  30.75 
 
 		 436 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>