More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3059 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  100 
 
 		 513 aa  1004    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  64.16 
 
 		 544 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  62.84 
 
 		 551 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  49.44 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  46.24 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  48 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  45.48 
 
 		 512 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  45.71 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  48.2 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  44.77 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  48.54 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  49.44 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  45.66 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  43.41 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  45.62 
 
 		 518 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  48.98 
 
 		 444 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  47.86 
 
 		 444 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  47.86 
 
 		 444 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  44.98 
 
 		 493 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  42.98 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  44.06 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  41.72 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  42.95 
 
 		 462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  43.75 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  43.04 
 
 		 453 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  40.35 
 
 		 473 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  42.05 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  38.45 
 
 		 474 aa  349  8e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  44.32 
 
 		 485 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  39.84 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  39.84 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  43.89 
 
 		 485 aa  346  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  39.75 
 
 		 478 aa  345  8e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  43.89 
 
 		 485 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  41.76 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  40.41 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  46.82 
 
 		 445 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  39.83 
 
 		 473 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  42.34 
 
 		 453 aa  333  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  40.62 
 
 		 453 aa  323  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  40.62 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  34.55 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  35.39 
 
 		 435 aa  256  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  35.21 
 
 		 445 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  35.52 
 
 		 436 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  34.78 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  35.7 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  34.78 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  34.78 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  34.32 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  35.24 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  34.32 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  34.32 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  35.16 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  34.32 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  34.55 
 
 		 434 aa  242  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  33.41 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  35.84 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  34.55 
 
 		 434 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  34.1 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  34.27 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  35.09 
 
 		 432 aa  238  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  35.01 
 
 		 434 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  35.67 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  33.87 
 
 		 434 aa  236  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  35.62 
 
 		 432 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  34.55 
 
 		 434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  33.1 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  34.1 
 
 		 434 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  33.33 
 
 		 447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  35.29 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  35.29 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  35.29 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  35.29 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  35.29 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  35.29 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  35.29 
 
 		 432 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  35.24 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  33.49 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  35.24 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  35.99 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  35.24 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  35.24 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  35.44 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  34.78 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  34.78 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  34.78 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.62 
 
 		 450 aa  231  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  34.78 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  34.78 
 
 		 432 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  35.16 
 
 		 435 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  35.93 
 
 		 434 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  33.56 
 
 		 435 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  32.8 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  34.1 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.56 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  32.96 
 
 		 436 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  33.18 
 
 		 436 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  34.1 
 
 		 434 aa  226  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.11 
 
 		 442 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>