More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2370 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  100 
 
 		 478 aa  947    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  73.26 
 
 		 485 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  69.77 
 
 		 473 aa  667    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  77.73 
 
 		 473 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  98.74 
 
 		 478 aa  939    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  98.74 
 
 		 478 aa  939    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  58.37 
 
 		 462 aa  529  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  54.34 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  57.98 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  50.77 
 
 		 452 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  52.31 
 
 		 452 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  50.77 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  51.89 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  50.11 
 
 		 453 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  47.02 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  49.44 
 
 		 453 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  50.44 
 
 		 452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  49.33 
 
 		 476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  49.01 
 
 		 453 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  48.07 
 
 		 494 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  48.46 
 
 		 453 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  48.67 
 
 		 493 aa  440  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  48.56 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  48.56 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  48.56 
 
 		 485 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  47.62 
 
 		 495 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  46.46 
 
 		 518 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  46.83 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  44.67 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  44.82 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  45.76 
 
 		 459 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  41.11 
 
 		 440 aa  353  4e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  43.17 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  42.6 
 
 		 442 aa  344  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  40.9 
 
 		 513 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  44.14 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  41.96 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  41.96 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  41.96 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  37.34 
 
 		 544 aa  312  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  37.22 
 
 		 551 aa  309  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  33.48 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.55 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  32.21 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  32.67 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  34.6 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  32.74 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  32.52 
 
 		 437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  32.81 
 
 		 448 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  32.52 
 
 		 436 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  33.33 
 
 		 436 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  32.96 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  32.96 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  32.07 
 
 		 436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  33.49 
 
 		 448 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  34.02 
 
 		 441 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  32.81 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  33.63 
 
 		 434 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.03 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  31.73 
 
 		 436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  32.66 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  31.44 
 
 		 436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.82 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  33.48 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  33.33 
 
 		 437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  32.74 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  33.33 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  31.72 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  31.99 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  34.15 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  31.54 
 
 		 448 aa  212  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  33.33 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  33.33 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  32.44 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  31.72 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  32.36 
 
 		 435 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  33.48 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  32.66 
 
 		 448 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  31.79 
 
 		 436 aa  210  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  31.32 
 
 		 448 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  31.54 
 
 		 448 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  33.11 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  31.44 
 
 		 435 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  31.54 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  31.54 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  32.81 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  30.75 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  32.29 
 
 		 436 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  32.31 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  31.99 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  31.99 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  29.87 
 
 		 445 aa  205  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  31.22 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  31.99 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  31.99 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  31.99 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  31.99 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  31.99 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  31.31 
 
 		 436 aa  203  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  31.14 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>