More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3235 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  100 
 
 		 512 aa  1027    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  54.34 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  54.34 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  54.34 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  53.78 
 
 		 473 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  52.22 
 
 		 473 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  51.12 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  51.69 
 
 		 485 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  51.36 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  48.9 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  51.47 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  49.33 
 
 		 452 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  47.87 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  48.02 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  48.77 
 
 		 452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  47.22 
 
 		 453 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  48.33 
 
 		 453 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  48.12 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  47.78 
 
 		 491 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  49.22 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  48.78 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  48.78 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  47.07 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  47.22 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  50.33 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  50.57 
 
 		 443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  47.54 
 
 		 454 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  44.19 
 
 		 494 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  50.11 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  49.21 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  45.9 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  48.54 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  43.74 
 
 		 495 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  48.54 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  47.64 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  48.21 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  50.34 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  43.84 
 
 		 544 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  43.97 
 
 		 551 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  45.45 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  43.65 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  38.22 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  36.64 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  35.76 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  35.36 
 
 		 450 aa  264  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  35.91 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  37.33 
 
 		 436 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  36.7 
 
 		 448 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  32.27 
 
 		 433 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  34.46 
 
 		 436 aa  246  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  35.02 
 
 		 435 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  36.87 
 
 		 429 aa  242  9e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  35.83 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  34.23 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  33.7 
 
 		 445 aa  240  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  33.87 
 
 		 435 aa  239  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  35.59 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  34.68 
 
 		 436 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  34.84 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  32.58 
 
 		 442 aa  237  5.0000000000000005e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.79 
 
 		 444 aa  236  8e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  34.68 
 
 		 443 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  34.47 
 
 		 437 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  34.46 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  33.26 
 
 		 434 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  33.71 
 
 		 434 aa  233  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  34.23 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  33.71 
 
 		 433 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  33.26 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  32.28 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  34.16 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  34.68 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  33.41 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  34.68 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  34.91 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  31.71 
 
 		 448 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  34.91 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  33.56 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  33.33 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  34.08 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  32.36 
 
 		 434 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  32.96 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  34.3 
 
 		 435 aa  226  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  31.49 
 
 		 448 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  31.58 
 
 		 431 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  31.45 
 
 		 447 aa  224  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  31.53 
 
 		 447 aa  224  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  33.41 
 
 		 437 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  31.49 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  33.94 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  31.26 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  32.15 
 
 		 448 aa  223  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  32.58 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  32.48 
 
 		 441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  32.89 
 
 		 434 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  31.04 
 
 		 448 aa  220  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  31.04 
 
 		 448 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  31.04 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  32.15 
 
 		 449 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  30.82 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>