More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0553 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  100 
 
 
474 aa  954    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  66.3 
 
 
485 aa  598  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  65.85 
 
 
485 aa  597  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  65.85 
 
 
485 aa  594  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  56.95 
 
 
476 aa  551  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  57.3 
 
 
491 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  58.72 
 
 
494 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  59.82 
 
 
493 aa  544  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  59.4 
 
 
495 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  47.8 
 
 
478 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  47.8 
 
 
478 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  47.02 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  49.54 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  47.52 
 
 
485 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  45.51 
 
 
473 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  47.79 
 
 
452 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  48.54 
 
 
452 aa  445  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  45.49 
 
 
473 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  47.79 
 
 
452 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  48.21 
 
 
453 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  47.07 
 
 
512 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  46.65 
 
 
453 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  48.76 
 
 
460 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  46 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  46.68 
 
 
453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  41.61 
 
 
518 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  45.54 
 
 
453 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  43.6 
 
 
454 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  40.22 
 
 
463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  42.25 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  42.25 
 
 
443 aa  349  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  39.64 
 
 
513 aa  342  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  40.32 
 
 
442 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  40.54 
 
 
544 aa  336  5.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  40.62 
 
 
459 aa  332  9e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  42.24 
 
 
445 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  39.42 
 
 
441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  37.03 
 
 
551 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  38.79 
 
 
444 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  38.14 
 
 
444 aa  312  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  38.14 
 
 
444 aa  312  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  33.41 
 
 
436 aa  249  7e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  32.81 
 
 
450 aa  237  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  30.56 
 
 
435 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  30.93 
 
 
448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  30.07 
 
 
434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  30.07 
 
 
434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  30.58 
 
 
436 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  31.97 
 
 
436 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  32.2 
 
 
444 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  30.8 
 
 
436 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.91 
 
 
434 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  30.8 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  31.97 
 
 
436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.66 
 
 
437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  30.56 
 
 
436 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  29.64 
 
 
445 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  29.66 
 
 
437 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  30.84 
 
 
437 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  30.84 
 
 
435 aa  210  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  29.57 
 
 
437 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  29.8 
 
 
447 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  29.8 
 
 
447 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  30.45 
 
 
441 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  30.39 
 
 
436 aa  207  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  30.39 
 
 
436 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  30.89 
 
 
448 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  31.11 
 
 
448 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  30.07 
 
 
448 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  29.93 
 
 
443 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  27.19 
 
 
442 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  30.07 
 
 
448 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  29.75 
 
 
436 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  28.7 
 
 
434 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  29.62 
 
 
448 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  29.84 
 
 
448 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  29.57 
 
 
436 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  30.89 
 
 
448 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  29.71 
 
 
437 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  30.22 
 
 
448 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  30.22 
 
 
448 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  29.71 
 
 
437 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  29.91 
 
 
449 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  29.91 
 
 
449 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  29.91 
 
 
449 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  29.91 
 
 
449 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  29.91 
 
 
449 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  29.91 
 
 
449 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  29.91 
 
 
449 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  29.53 
 
 
436 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  29.02 
 
 
436 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  28.57 
 
 
436 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  30.89 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  28.8 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.44 
 
 
433 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  29.25 
 
 
434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  29.84 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  29.25 
 
 
434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  29.25 
 
 
434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  29.71 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0156375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>