More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1775 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  100 
 
 		 444 aa  893    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  100 
 
 		 444 aa  893    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  95.95 
 
 		 444 aa  831    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  76.13 
 
 		 459 aa  630  1e-179  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  71.78 
 
 		 442 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  71.11 
 
 		 443 aa  627  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  67.49 
 
 		 441 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  48.12 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  47.49 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  45.25 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  45.07 
 
 		 544 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  43.31 
 
 		 518 aa  348  9e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  42.41 
 
 		 478 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  42.19 
 
 		 478 aa  342  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  42.19 
 
 		 478 aa  342  7e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  42.38 
 
 		 485 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  43.89 
 
 		 485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  43.67 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  43.4 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  43.44 
 
 		 485 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  41.48 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  41.89 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  41.22 
 
 		 452 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  40.62 
 
 		 452 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  41.22 
 
 		 473 aa  328  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  41.81 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  42.6 
 
 		 463 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  40.67 
 
 		 476 aa  326  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  41.29 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  41.07 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  42.89 
 
 		 462 aa  323  3e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  41.03 
 
 		 551 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  41.69 
 
 		 495 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  41.5 
 
 		 494 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  41.29 
 
 		 453 aa  316  6e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  43.71 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  38.14 
 
 		 474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  41.44 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  39.96 
 
 		 453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  41.23 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  41.07 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  33.56 
 
 		 434 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  31.96 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  33.87 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.26 
 
 		 450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  33.33 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  32.87 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  33.94 
 
 		 448 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  32.73 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  31.88 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  31.88 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  31.88 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  32.38 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  32.43 
 
 		 437 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  32.16 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  32.73 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  30.84 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  31.51 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  31.44 
 
 		 432 aa  206  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  32.2 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  31.76 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  31.51 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  31.98 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  31.25 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  31.51 
 
 		 432 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  31.92 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.45 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.38 
 
 		 434 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  31.97 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  29.64 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  31.56 
 
 		 436 aa  204  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  32.66 
 
 		 442 aa  203  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  31.51 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  31.03 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  31.89 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  31.28 
 
 		 432 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  32.88 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  31.05 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  30.72 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  31.6 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  31.56 
 
 		 433 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.32 
 
 		 434 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  32.51 
 
 		 434 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0320  trigger factor, putative  28.21 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00487785  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  28.96 
 
 		 447 aa  195  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  31.14 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  31.38 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.83 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  34.17 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  30.58 
 
 		 436 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  30.58 
 
 		 436 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>