More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0916 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  100 
 
 		 440 aa  870    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  57.67 
 
 		 445 aa  457  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  48.07 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  48.52 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  42.95 
 
 		 518 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  43.88 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  45.64 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  43.24 
 
 		 512 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  42.41 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  42.25 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  41.96 
 
 		 473 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  43.79 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  41.11 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  41.11 
 
 		 478 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  42.89 
 
 		 485 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  41.11 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  42.86 
 
 		 452 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  41.91 
 
 		 551 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  41.83 
 
 		 453 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  42.28 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  42.25 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  42.73 
 
 		 453 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  42.44 
 
 		 454 aa  340  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  43.21 
 
 		 485 aa  339  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  42.63 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  42.98 
 
 		 485 aa  336  5.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  39.69 
 
 		 476 aa  335  7e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  41.81 
 
 		 491 aa  335  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  42.76 
 
 		 485 aa  332  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  40.32 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  41 
 
 		 544 aa  331  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  40.45 
 
 		 453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  40.09 
 
 		 494 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  40.55 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  41.1 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  40.64 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  42.11 
 
 		 444 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  41.65 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  41.65 
 
 		 444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  39.95 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  39.82 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  38.19 
 
 		 448 aa  262  8e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  35.45 
 
 		 450 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  35.2 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.03 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  33.11 
 
 		 436 aa  229  8e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  33.49 
 
 		 436 aa  229  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  33.64 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  36.02 
 
 		 434 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  33.64 
 
 		 435 aa  219  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  35.45 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  32.64 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  34.32 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  33.49 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  31.54 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  34.68 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  36.18 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  34.46 
 
 		 437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  35.96 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  34.46 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  31.78 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  34.68 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  31.54 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  33.79 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  32.8 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  32.8 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  33.26 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  33.79 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  32.95 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  34.76 
 
 		 434 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  33.33 
 
 		 436 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  31.74 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  32.57 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  33.71 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  31.74 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  34.76 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  34.76 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  32.49 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  33.71 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  32.41 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  31.74 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  29.65 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  29.34 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  32.11 
 
 		 436 aa  206  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  34.09 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  34.54 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.71 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  29.44 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  34.09 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  34.09 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  34.09 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  34.01 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.21 
 
 		 435 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  32.47 
 
 		 432 aa  202  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  32.05 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  32.05 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  32.05 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  32.57 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  31.82 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>