More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3590 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  100 
 
 		 452 aa  901    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  60.04 
 
 		 452 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  59.38 
 
 		 452 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  56.95 
 
 		 453 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  59.16 
 
 		 453 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  56.82 
 
 		 453 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  55.53 
 
 		 452 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2230  trigger factor  55.93 
 
 		 453 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  53.18 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  52.34 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  52.67 
 
 		 473 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  52.53 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  52.31 
 
 		 478 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  52.53 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  55.06 
 
 		 460 aa  479  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  52.82 
 
 		 485 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  52.56 
 
 		 491 aa  467  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  48.99 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  49.77 
 
 		 494 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  51.9 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  48.54 
 
 		 474 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  51.9 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  49.66 
 
 		 512 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  52.35 
 
 		 485 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  50.46 
 
 		 495 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  50.34 
 
 		 493 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  46.44 
 
 		 518 aa  418  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  44.89 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  45.95 
 
 		 513 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  43.88 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  43.46 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  43.68 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  43.3 
 
 		 443 aa  352  7e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  44.02 
 
 		 441 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  41.76 
 
 		 551 aa  344  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  43.47 
 
 		 459 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3323  trigger factor  45.15 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.113258 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  41.44 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  40.99 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  40.99 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  41.03 
 
 		 544 aa  323  5e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  33.99 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  33.55 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  33.33 
 
 		 435 aa  232  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  33.18 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  35.32 
 
 		 448 aa  227  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  34.08 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  32.36 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  32.58 
 
 		 436 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  34.23 
 
 		 434 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  31.92 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  32.74 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  34.16 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  34.15 
 
 		 441 aa  220  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  30.7 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  34.6 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  32.96 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  32.96 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  34.16 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  31.31 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  31.98 
 
 		 436 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  34.66 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  30.56 
 
 		 447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  33.65 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.65 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  33.71 
 
 		 437 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  32.21 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  33.71 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  33.93 
 
 		 443 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.33 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  33.71 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  32.94 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  31.46 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  33.18 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  33.18 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  33.18 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  33.18 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  33.18 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  33.18 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  33.77 
 
 		 436 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  33.18 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  33.18 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  32.13 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  33.71 
 
 		 437 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  32.13 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  32.89 
 
 		 434 aa  206  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  32.61 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  33.33 
 
 		 434 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  31.07 
 
 		 435 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  32.51 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  32.51 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  32.51 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  30.87 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  32.47 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  33.56 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.72 
 
 		 435 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  32.44 
 
 		 432 aa  202  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  34.07 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  32.44 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  32.21 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>