More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1239 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1239  trigger factor  100 
 
 		 433 aa  862    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  88.91 
 
 		 433 aa  783    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  88.91 
 
 		 433 aa  783    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  60.47 
 
 		 428 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  60.24 
 
 		 428 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  57.88 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  56.84 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  57.55 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  57.31 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  57.31 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  57.31 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  57.31 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  57.55 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  57.31 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  56.84 
 
 		 425 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  56.84 
 
 		 425 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  49.08 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  47.44 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  49.77 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  45.87 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  45.56 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  44.84 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  45.67 
 
 		 427 aa  378  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  44.92 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  45.2 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  44.5 
 
 		 426 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  42.35 
 
 		 438 aa  351  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  43.33 
 
 		 428 aa  346  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  40.93 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  42.66 
 
 		 432 aa  338  8e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  41.92 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  42.89 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  39.44 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  39.58 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  41.37 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  41.72 
 
 		 438 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  42.08 
 
 		 428 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  35.12 
 
 		 438 aa  296  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  41.8 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  36.23 
 
 		 488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  38 
 
 		 451 aa  279  6e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  34.6 
 
 		 435 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  34.7 
 
 		 478 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  33.41 
 
 		 435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  36.6 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  34.45 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  33.94 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  34.3 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  36.8 
 
 		 439 aa  237  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  34.88 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  33.18 
 
 		 433 aa  233  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  35.79 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  31.74 
 
 		 426 aa  224  3e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  33.26 
 
 		 448 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  34.72 
 
 		 435 aa  223  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  32.95 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.59 
 
 		 500 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  34.7 
 
 		 443 aa  219  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  31.38 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  32.13 
 
 		 481 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  30.93 
 
 		 472 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.65 
 
 		 434 aa  216  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  33.01 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.78 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  34.62 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  31.36 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  30.7 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  30.99 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.88 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  32.04 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  33.76 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  31.28 
 
 		 448 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  32.27 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  30.94 
 
 		 485 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30.86 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  30.36 
 
 		 461 aa  206  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  31.02 
 
 		 434 aa  206  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.59 
 
 		 435 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  30.77 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  31.71 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  28.61 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  30.09 
 
 		 481 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  29.14 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  31.01 
 
 		 447 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  31.48 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  31.48 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  31.48 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  31.48 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  31.48 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  31.49 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  31.48 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  31.48 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.81 
 
 		 445 aa  202  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  28.61 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  31.48 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  30.41 
 
 		 435 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  29.48 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  29.95 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  30.63 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  30.63 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>