More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2313 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  100 
 
 
430 aa  844    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  39.19 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  41.22 
 
 
428 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  40.65 
 
 
432 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  41.45 
 
 
428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  37.3 
 
 
426 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  40.42 
 
 
427 aa  271  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  39.58 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  39.81 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  38.57 
 
 
428 aa  262  8.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  37.7 
 
 
435 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  38.42 
 
 
428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  37.24 
 
 
429 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  37.18 
 
 
428 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  36.45 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  35.97 
 
 
435 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  36.89 
 
 
451 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  35.9 
 
 
449 aa  236  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  34.88 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  35.14 
 
 
435 aa  233  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  34.74 
 
 
439 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.5 
 
 
446 aa  227  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  37.72 
 
 
428 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  37.47 
 
 
428 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  34.19 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  34.19 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  34.75 
 
 
427 aa  220  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  33.81 
 
 
427 aa  218  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  32.6 
 
 
439 aa  218  2e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  37.95 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  32.71 
 
 
438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  32.1 
 
 
435 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  33.1 
 
 
446 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31.07 
 
 
488 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  35.88 
 
 
427 aa  206  9e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  32.1 
 
 
435 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.53 
 
 
434 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  33.33 
 
 
431 aa  199  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  34.64 
 
 
433 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.26 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  33.24 
 
 
431 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  31.75 
 
 
442 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.47 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  32.99 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  32.99 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  32.99 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.62 
 
 
500 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  29.24 
 
 
448 aa  182  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30.75 
 
 
434 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  32.22 
 
 
432 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  30.03 
 
 
434 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  27.97 
 
 
448 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  32.22 
 
 
432 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  32.12 
 
 
433 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.7 
 
 
434 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  32.79 
 
 
437 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  31.96 
 
 
432 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.43 
 
 
437 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  34.16 
 
 
433 aa  177  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  30.03 
 
 
434 aa  176  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  30.03 
 
 
434 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  30.93 
 
 
434 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  30.03 
 
 
434 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  31.96 
 
 
432 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  31.55 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  32.9 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  30.65 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  28.43 
 
 
435 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  29.87 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  31.84 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  29.87 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  29.87 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  29.87 
 
 
434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.17 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  29.64 
 
 
434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  31.14 
 
 
435 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  30.4 
 
 
447 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  32.25 
 
 
443 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.81 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  32.25 
 
 
437 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  27.16 
 
 
430 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  28.9 
 
 
432 aa  173  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>