More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0767 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  100 
 
 		 424 aa  842    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  39.19 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  36.83 
 
 		 428 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  36.09 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  39.8 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  39.8 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  39.8 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  39.8 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  39.8 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  39.8 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  39.8 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  36.81 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  39.8 
 
 		 425 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  39.8 
 
 		 425 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  38.75 
 
 		 425 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  37.64 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  35.98 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  39.35 
 
 		 427 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  38.68 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  38.06 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  35.79 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  37.84 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  34.93 
 
 		 435 aa  226  7e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  35.53 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  35.04 
 
 		 432 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  37.14 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  35.53 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  36.64 
 
 		 428 aa  222  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  33.88 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  39.89 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  32.89 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  37.23 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  37.23 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  33.5 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  35.35 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  37.57 
 
 		 451 aa  206  9e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  36.56 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  35.81 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  33.43 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  33.08 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  34.01 
 
 		 513 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  33.06 
 
 		 442 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  33.24 
 
 		 439 aa  189  8e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  32.97 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  34.16 
 
 		 434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  33.24 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  33.33 
 
 		 433 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  32.51 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  32.51 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  33.7 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  33.06 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  34.06 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.65 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  28.95 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  31.74 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  32.23 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  34.44 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  35.91 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  35.15 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  33.51 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  32.97 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  33.42 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  33.33 
 
 		 431 aa  175  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  34.05 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.4 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  33.75 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  30.89 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  33.75 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  33.75 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  33.75 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  29.7 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  27.22 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  31.16 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  29.69 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  30.9 
 
 		 473 aa  170  5e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  29.67 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  29.67 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  29.67 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  33.79 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  32.67 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  32.29 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  30.2 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  32.2 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  30.59 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  30.3 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  30.81 
 
 		 512 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  33.24 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  30.11 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  30.27 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  31.82 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  32.6 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  31.3 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  32.87 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  30.26 
 
 		 544 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  30.52 
 
 		 495 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  32.6 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  28.13 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  34.72 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  31.44 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>