More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1386 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  99.53 
 
 
428 aa  838    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  100 
 
 
428 aa  841    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  46.26 
 
 
435 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  50.77 
 
 
428 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  45.79 
 
 
428 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  50.9 
 
 
425 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  50.9 
 
 
425 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  50.38 
 
 
427 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  50.9 
 
 
425 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  50.64 
 
 
425 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  50.38 
 
 
425 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  50.38 
 
 
425 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  50.38 
 
 
425 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  50.38 
 
 
425 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  50.38 
 
 
425 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  48.08 
 
 
425 aa  359  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  44.94 
 
 
426 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  43.53 
 
 
435 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  44.39 
 
 
432 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  43.82 
 
 
428 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  45.22 
 
 
428 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  41.3 
 
 
435 aa  339  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  43.26 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  42.25 
 
 
429 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  43.16 
 
 
446 aa  322  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  41.23 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  41.23 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  45.38 
 
 
438 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  40.66 
 
 
433 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  41.01 
 
 
438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  39.77 
 
 
446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  37.15 
 
 
438 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  38.89 
 
 
435 aa  282  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  40.43 
 
 
427 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  37.74 
 
 
436 aa  278  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  40.84 
 
 
427 aa  277  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  39.43 
 
 
451 aa  276  6e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  38.54 
 
 
435 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  39.51 
 
 
427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  39.41 
 
 
433 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  40.94 
 
 
431 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  37.27 
 
 
431 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  35.6 
 
 
488 aa  262  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  37.76 
 
 
449 aa  261  1e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  38.07 
 
 
439 aa  259  7e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  38.92 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  35.8 
 
 
430 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  35.65 
 
 
439 aa  239  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  36.19 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  37.31 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  36.01 
 
 
424 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  34.63 
 
 
440 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  32.33 
 
 
442 aa  219  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  34.84 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  32.04 
 
 
437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  31.48 
 
 
468 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  31.22 
 
 
485 aa  206  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  33.59 
 
 
426 aa  205  1e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  32.36 
 
 
471 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  28.5 
 
 
454 aa  199  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  29.14 
 
 
483 aa  199  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  29.22 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  31.09 
 
 
435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  30.18 
 
 
481 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  32.28 
 
 
432 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  33.16 
 
 
434 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  34.1 
 
 
500 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  31.33 
 
 
472 aa  194  2e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  28.57 
 
 
474 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  33.09 
 
 
433 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  32.91 
 
 
512 aa  193  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  29.82 
 
 
435 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  33.07 
 
 
469 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  31.69 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  33.09 
 
 
444 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  30.79 
 
 
463 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  31.85 
 
 
435 aa  189  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  28.74 
 
 
460 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  30.86 
 
 
441 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  29.33 
 
 
465 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  28.5 
 
 
448 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1379  trigger factor  32.98 
 
 
451 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  30.22 
 
 
500 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  29.41 
 
 
479 aa  186  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  30.16 
 
 
463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  29.68 
 
 
479 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  32.2 
 
 
434 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  32.11 
 
 
447 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  32.41 
 
 
443 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  32.13 
 
 
443 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  29.82 
 
 
513 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  28.42 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  28.42 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  30.86 
 
 
435 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  31.67 
 
 
434 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  31.67 
 
 
434 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  31.67 
 
 
434 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  32.12 
 
 
432 aa  180  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  31.28 
 
 
434 aa  180  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.91 
 
 
448 aa  180  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>