More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_614 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0709  trigger factor  92.19 
 
 		 448 aa  840    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  90.83 
 
 		 447 aa  831    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  100 
 
 		 447 aa  904    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.49 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  34.96 
 
 		 446 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.21 
 
 		 500 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.4 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  34.04 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  32.31 
 
 		 435 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  34.2 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  33.17 
 
 		 435 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  32.64 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.36 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  31.88 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  31.88 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.85 
 
 		 438 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.97 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.45 
 
 		 425 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  32.7 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  32.7 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  32.7 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  32.7 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  32.7 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  32.7 
 
 		 425 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.87 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.18 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.18 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31.7 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  30.85 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.53 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  28.71 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.33 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  32.89 
 
 		 438 aa  189  7e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  29.35 
 
 		 460 aa  184  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  29.17 
 
 		 431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.93 
 
 		 433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.11 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  28.22 
 
 		 471 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.8 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  29.16 
 
 		 427 aa  179  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.79 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.04 
 
 		 435 aa  176  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  28.03 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  29.31 
 
 		 506 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.54 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  25.96 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  29.02 
 
 		 479 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  28.4 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  30.1 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  26.93 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  25.38 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  26.98 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  29.49 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  26.99 
 
 		 426 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.6 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  27.43 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  27.43 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  25.75 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  26.51 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  29.11 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  29.11 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  29.11 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  26.27 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.48 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  31.64 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.3 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.87 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  28.72 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  27.18 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  29.26 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  28.43 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  31.64 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  26.82 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  25.45 
 
 		 427 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  25.56 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  26.51 
 
 		 437 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.48 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  27.74 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  29.1 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.39 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  27.41 
 
 		 448 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  27.76 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  27.76 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  27.76 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  27.76 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  25.91 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  27.37 
 
 		 428 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  26.82 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  27.44 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  28.05 
 
 		 479 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  26.67 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  26.67 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  26.67 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  28.16 
 
 		 448 aa  149  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  26.67 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  26.67 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  26.63 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  26.91 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  26.23 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  25.77 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>