More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0066 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  89.29 
 
 
447 aa  808    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  100 
 
 
469 aa  937    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  67.25 
 
 
479 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  56.49 
 
 
471 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  56.24 
 
 
472 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  55.33 
 
 
472 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  47.51 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  48.05 
 
 
473 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  47.83 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  48.05 
 
 
474 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  43.47 
 
 
474 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  44.39 
 
 
471 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  41.56 
 
 
460 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  40.78 
 
 
485 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  38.43 
 
 
479 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  38.2 
 
 
500 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  38.07 
 
 
455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  38.07 
 
 
455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  31.81 
 
 
433 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.03 
 
 
429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.38 
 
 
435 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  30.75 
 
 
426 aa  206  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.61 
 
 
433 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31.17 
 
 
446 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.08 
 
 
433 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.08 
 
 
433 aa  204  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  32.79 
 
 
432 aa  204  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.32 
 
 
428 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  34.14 
 
 
425 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  34.14 
 
 
425 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.87 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.87 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.87 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.87 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.87 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.87 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.98 
 
 
488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.6 
 
 
425 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  33.6 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.53 
 
 
427 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  27.98 
 
 
431 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.7 
 
 
435 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  30.34 
 
 
446 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.76 
 
 
438 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.99 
 
 
428 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.89 
 
 
435 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  29.62 
 
 
436 aa  190  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  28.06 
 
 
433 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  31.3 
 
 
444 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30.65 
 
 
436 aa  186  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  31.29 
 
 
434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.08 
 
 
434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  32.58 
 
 
434 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  34.49 
 
 
430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  32.39 
 
 
436 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  30.07 
 
 
427 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  30.18 
 
 
439 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.37 
 
 
442 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  32.55 
 
 
428 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  32.84 
 
 
428 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  32.07 
 
 
441 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  31.19 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  31.19 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.45 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  31.19 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  29.66 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.7 
 
 
440 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  29.6 
 
 
435 aa  173  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.4 
 
 
445 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.39 
 
 
434 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  27.16 
 
 
428 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  31.23 
 
 
432 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  31.6 
 
 
429 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  32.07 
 
 
434 aa  170  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  31.6 
 
 
429 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.54 
 
 
434 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  30.51 
 
 
435 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  29.96 
 
 
436 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  31.03 
 
 
434 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  30.89 
 
 
429 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  31.03 
 
 
434 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  31.03 
 
 
434 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  29.77 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  30.51 
 
 
434 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  30.51 
 
 
434 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  30.51 
 
 
434 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  30.51 
 
 
434 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  29.4 
 
 
434 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  30.81 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  30.81 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  30.81 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  30.81 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  29.93 
 
 
427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  30.81 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  30.77 
 
 
434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  31.14 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  30.3 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  30.3 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  30.3 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  30.3 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>