More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_18641 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  83.03 
 
 
473 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  95.29 
 
 
481 aa  850    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  100 
 
 
474 aa  935    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  95.65 
 
 
477 aa  837    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  51.24 
 
 
472 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  52.39 
 
 
472 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  48.06 
 
 
469 aa  455  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  48.67 
 
 
479 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  50.23 
 
 
471 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  45.09 
 
 
447 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  38.92 
 
 
471 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  35.99 
 
 
479 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  35.85 
 
 
485 aa  293  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  35.46 
 
 
474 aa  292  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  33.48 
 
 
500 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  34.72 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  32.33 
 
 
455 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  32.33 
 
 
455 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.62 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.77 
 
 
435 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  34.13 
 
 
432 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.43 
 
 
429 aa  195  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  29.11 
 
 
488 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  32.42 
 
 
446 aa  189  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.77 
 
 
436 aa  187  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.79 
 
 
438 aa  187  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  27.96 
 
 
433 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  27.96 
 
 
433 aa  186  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  34.55 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.25 
 
 
425 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  32.56 
 
 
439 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.38 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.38 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.38 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.38 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.38 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.38 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.38 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  30.91 
 
 
425 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  31.15 
 
 
425 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  30.1 
 
 
438 aa  176  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  33.33 
 
 
431 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.87 
 
 
427 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  27.65 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  29.98 
 
 
428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  31.22 
 
 
449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  27.58 
 
 
426 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.47 
 
 
435 aa  170  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.77 
 
 
434 aa  170  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.68 
 
 
435 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  29.86 
 
 
433 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.19 
 
 
427 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  31.82 
 
 
424 aa  164  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.14 
 
 
428 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.6 
 
 
434 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.86 
 
 
434 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  28.93 
 
 
434 aa  162  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  27.59 
 
 
435 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  28.89 
 
 
444 aa  162  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  28.64 
 
 
427 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  28.54 
 
 
434 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  28.88 
 
 
436 aa  159  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  29.07 
 
 
463 aa  159  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  30.41 
 
 
435 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  28.87 
 
 
434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  29.37 
 
 
434 aa  156  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  28.8 
 
 
434 aa  156  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  29.7 
 
 
436 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  28.61 
 
 
427 aa  156  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  26.74 
 
 
435 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  26.4 
 
 
478 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  31.14 
 
 
428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  28.44 
 
 
441 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  28.97 
 
 
434 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  28.97 
 
 
434 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  28.97 
 
 
434 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  28.97 
 
 
434 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  29.7 
 
 
434 aa  154  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  30.84 
 
 
428 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  29.47 
 
 
429 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.05 
 
 
428 aa  153  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  28.01 
 
 
445 aa  151  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  27.64 
 
 
434 aa  152  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  29.23 
 
 
429 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  29.21 
 
 
434 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  29.21 
 
 
434 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  29.45 
 
 
434 aa  151  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  29.37 
 
 
434 aa  151  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.27 
 
 
438 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.57 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  28.83 
 
 
544 aa  147  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.08 
 
 
437 aa  147  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  30.18 
 
 
434 aa  146  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  27.56 
 
 
440 aa  146  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  25.94 
 
 
435 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  26.54 
 
 
448 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  26.13 
 
 
432 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  27.6 
 
 
451 aa  144  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  28.22 
 
 
436 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  28.44 
 
 
436 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.132696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>