More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0510 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  100 
 
 		 448 aa  904    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  55.56 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  51.4 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  53.95 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  50.35 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  46.14 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  33.41 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  32.09 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  29.37 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  29.26 
 
 		 435 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.49 
 
 		 435 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  27.84 
 
 		 437 aa  202  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  31 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  31.25 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  31.43 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  28.44 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.38 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.44 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  29.7 
 
 		 512 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.18 
 
 		 439 aa  189  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.32 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.91 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.91 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.75 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.12 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.31 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  28.64 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.23 
 
 		 442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.21 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  28.14 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.67 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  29.23 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  27.08 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  28.71 
 
 		 436 aa  179  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  27.97 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  28.19 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  27.38 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  28.5 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  27.06 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  29.19 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.19 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.19 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.19 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.19 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.19 
 
 		 425 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  26.82 
 
 		 437 aa  177  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  28.95 
 
 		 425 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  28.31 
 
 		 454 aa  176  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  31.41 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  29.19 
 
 		 425 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  29.19 
 
 		 425 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  28.67 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  29.57 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  28.12 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  27.19 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  27.19 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  27.19 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  26.78 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  29.65 
 
 		 471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  27.21 
 
 		 435 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  28.81 
 
 		 430 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  28.92 
 
 		 432 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  30.33 
 
 		 513 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  29.06 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  26.17 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  28.07 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  29.7 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  28.34 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.1 
 
 		 429 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  27.68 
 
 		 518 aa  169  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  29.72 
 
 		 469 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.24 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  28.92 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.24 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.74 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  27.63 
 
 		 429 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  27.63 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  27.04 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.1 
 
 		 432 aa  166  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  26.94 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  26.94 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  26.94 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  26.94 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  26.94 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  26.94 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  26.94 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  24.82 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  27.62 
 
 		 551 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  26.51 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  26.56 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  27.4 
 
 		 436 aa  163  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  24.77 
 
 		 437 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  31.41 
 
 		 446 aa  163  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  25.06 
 
 		 436 aa  163  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  26.64 
 
 		 434 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  26.09 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  26.09 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  26.09 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  26.09 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  26.09 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>