More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2222 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  100 
 
 		 438 aa  889    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  67.82 
 
 		 432 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  67.45 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  56.38 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  50.68 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  48.6 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  31.31 
 
 		 433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.77 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  27.95 
 
 		 437 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.34 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  31 
 
 		 439 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.84 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  29.77 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.14 
 
 		 435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  30.35 
 
 		 463 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  27.56 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  27.27 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  28.97 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  30.07 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.71 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.73 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  28.24 
 
 		 512 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  27.7 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.16 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.41 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.23 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  28.93 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.48 
 
 		 428 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  27.38 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  30.41 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.71 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  26.77 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  26.77 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  27.1 
 
 		 488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  29.95 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  29.95 
 
 		 429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  28.6 
 
 		 518 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.2 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  26.25 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  27.27 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  29.14 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  28.8 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  26.87 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  29.43 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  27.27 
 
 		 440 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  28.64 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  27.71 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.31 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  30.22 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  28.94 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  26.91 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  29.66 
 
 		 459 aa  156  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  27.61 
 
 		 448 aa  155  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  25.17 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.15 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  27.75 
 
 		 551 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  25.59 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  29.14 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  29.94 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  28.31 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  26.51 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  28.81 
 
 		 513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  29.17 
 
 		 507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  28.29 
 
 		 425 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  28.29 
 
 		 425 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  28.29 
 
 		 425 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  28.29 
 
 		 425 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  28.29 
 
 		 425 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  28.29 
 
 		 425 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.15 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  30.09 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  28.89 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  28 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  27.65 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  28.07 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.38 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  26.99 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  26.99 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  24.6 
 
 		 437 aa  152  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  25 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  30.34 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  27.12 
 
 		 469 aa  150  4e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  30.36 
 
 		 479 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  29.33 
 
 		 424 aa  149  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  26.22 
 
 		 464 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  29.94 
 
 		 450 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  26.98 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  26.98 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  27.46 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  28.8 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  24.46 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  27.08 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  26.53 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  28.54 
 
 		 485 aa  146  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  26.74 
 
 		 436 aa  146  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  26.33 
 
 		 491 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  26 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  27.9 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  26.21 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  26.21 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>