More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2478 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  78.23 
 
 		 468 aa  701    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  100 
 
 		 463 aa  914    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  54.42 
 
 		 481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  54.4 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  53.36 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  48.32 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  47.45 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  47.14 
 
 		 483 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  44.23 
 
 		 507 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  47.36 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  44.29 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  46.24 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  47.94 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  46.22 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  43.97 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  44.52 
 
 		 452 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  45.43 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  45.43 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  43.04 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  45.43 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  43.32 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  42.79 
 
 		 491 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  43.84 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  46.8 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  43.64 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  42.92 
 
 		 479 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  42.89 
 
 		 465 aa  360  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  43.71 
 
 		 466 aa  359  7e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  43.18 
 
 		 454 aa  352  7e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  43.96 
 
 		 460 aa  345  7e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  45.58 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  44.16 
 
 		 449 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  42.69 
 
 		 455 aa  329  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  43.12 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  43.11 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  43.86 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  42.24 
 
 		 519 aa  317  2e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  40.13 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.42 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  35.51 
 
 		 488 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  32.4 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  32.48 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  34.14 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.86 
 
 		 425 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  32.78 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.16 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  32.95 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  33.8 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  33.95 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  32.36 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.37 
 
 		 429 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  34.41 
 
 		 428 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  32.56 
 
 		 435 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  31.2 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  30.96 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  30.96 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  30.96 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  30.96 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  30.96 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  30.96 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  30.71 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  30.71 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.94 
 
 		 433 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.94 
 
 		 433 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  32.01 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  30.96 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.29 
 
 		 435 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  30.21 
 
 		 428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  31.63 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  31.7 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.2 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  30.07 
 
 		 440 aa  179  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.97 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  30.16 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  32.27 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  31.37 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  30.16 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30.59 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  30.14 
 
 		 428 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  29.75 
 
 		 427 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.45 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  29.86 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  30.94 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  30.73 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  29.23 
 
 		 448 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  30.26 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  33.53 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  29.67 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  29.67 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  29.67 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  29.67 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  32.49 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  30.22 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.13 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  29.74 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.31 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  29.78 
 
 		 432 aa  166  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.51 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  34.49 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>