More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0186 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  74.65 
 
 		 439 aa  644    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  98.42 
 
 		 444 aa  852    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  100 
 
 		 444 aa  864    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1498  trigger factor  62.3 
 
 		 441 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  61.59 
 
 		 443 aa  534  1e-150  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  60.8 
 
 		 435 aa  519  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  59.23 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  51.29 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  43.59 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  35.06 
 
 		 436 aa  205  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  32.05 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  30 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  31.53 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  31.53 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  33.58 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  31.64 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  36.55 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  34.59 
 
 		 428 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  31.31 
 
 		 434 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  31.49 
 
 		 444 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  31.51 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.95 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  30.54 
 
 		 434 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30.39 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.1 
 
 		 441 aa  176  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  32.05 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  29.29 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.56 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  32.46 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  29.9 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  30.57 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.24 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.99 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  32.17 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.07 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  30.22 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  30.22 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  30.22 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  30.22 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  30.22 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  30.22 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  30.22 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  30.22 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  30.22 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  30.05 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  30.32 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  33.6 
 
 		 433 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  27.34 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  30.46 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  30.47 
 
 		 432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  30.31 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  30.47 
 
 		 432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  30.31 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  32.3 
 
 		 544 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  30.52 
 
 		 432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  33.01 
 
 		 473 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  30.68 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  30.47 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  30.47 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  30.47 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  31.04 
 
 		 443 aa  166  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  30.19 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  31.3 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.81 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  30.49 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  30.05 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.17 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.62 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.17 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  32.25 
 
 		 513 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.84 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.84 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.17 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.17 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.17 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.17 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.17 
 
 		 425 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  31.61 
 
 		 436 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  28.38 
 
 		 435 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  33.33 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  30.22 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  33.33 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  32.14 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  29.06 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  33.25 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  29.48 
 
 		 434 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.73 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  27.83 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  27.83 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  29.46 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  30.73 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  28.5 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  28.54 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  28.76 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.43 
 
 		 425 aa  160  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  29.13 
 
 		 485 aa  160  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  28.76 
 
 		 434 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  28.76 
 
 		 434 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  32.18 
 
 		 473 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  28.76 
 
 		 434 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>