More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1480 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  74.41 
 
 		 444 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  74.65 
 
 		 444 aa  643    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  100 
 
 		 439 aa  860    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1498  trigger factor  61.36 
 
 		 441 aa  527  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  60.66 
 
 		 443 aa  522  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  59.16 
 
 		 435 aa  512  1e-144  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  56.24 
 
 		 437 aa  479  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  49.65 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  44.13 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  33.41 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  35.52 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  36.62 
 
 		 427 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  31.65 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28.67 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  37.96 
 
 		 428 aa  177  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  34.68 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  34.68 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  34.68 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  34.68 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  34.68 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  34.68 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  34.68 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  35.52 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  35.52 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  31.62 
 
 		 447 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  32.3 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  30.5 
 
 		 444 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  34.14 
 
 		 425 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  31.13 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  32.14 
 
 		 472 aa  170  4e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  30.91 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  30.81 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  30.91 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  31.7 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  32.61 
 
 		 430 aa  167  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  31.22 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  31.7 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  33.25 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  30.68 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  30.2 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.13 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  31.28 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  32.31 
 
 		 439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  30.54 
 
 		 512 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  30.71 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  32.51 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.83 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  29.59 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.45 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.77 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  30.15 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  30.95 
 
 		 544 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  32.11 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  30.57 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  31.54 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  31.54 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  33.02 
 
 		 513 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  29.93 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  31.44 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  32.02 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  30.1 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.15 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  30.54 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  30.54 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  30.54 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.07 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  31.59 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  31.59 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  31.59 
 
 		 434 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  31.59 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  29.77 
 
 		 436 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  28.82 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  29.19 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  34.12 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  31.85 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  29.53 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  30.73 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  31.59 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  29.06 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.3 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  30.13 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  30.02 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  28.54 
 
 		 434 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  30.65 
 
 		 436 aa  153  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  29.37 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  32.32 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  33.08 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  29.92 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  31.59 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  31.59 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>