More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0016 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  100 
 
 		 437 aa  863    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  62.99 
 
 		 435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  60.28 
 
 		 443 aa  520  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  59.62 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  59.39 
 
 		 444 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1498  trigger factor  58.78 
 
 		 441 aa  502  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  56.44 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  45.92 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  38.69 
 
 		 433 aa  306  3e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.18 
 
 		 445 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28.67 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  30.82 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  30.82 
 
 		 447 aa  179  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  32.65 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  32.65 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  32.65 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  32.65 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  32.65 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  32.65 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  32.65 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  32.65 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  32.65 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  29.32 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  30.15 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  29.91 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  29.38 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  30.56 
 
 		 444 aa  173  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  29.36 
 
 		 434 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  32.12 
 
 		 432 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  32.12 
 
 		 432 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  32.12 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  32.12 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  32.12 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  29.77 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.19 
 
 		 429 aa  170  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  29.98 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  30.75 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  33.79 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  30.25 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  32.24 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  29.52 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  30.37 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  30.37 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  30.37 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.91 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  29.52 
 
 		 435 aa  166  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  30.77 
 
 		 512 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  29.98 
 
 		 544 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  30.47 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  29.98 
 
 		 434 aa  163  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.29 
 
 		 436 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.09 
 
 		 434 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  29.65 
 
 		 494 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  30.73 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  27.98 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  30.87 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  29.18 
 
 		 472 aa  160  3e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  28.83 
 
 		 435 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  28.22 
 
 		 433 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  28.28 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  27.77 
 
 		 474 aa  159  7e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  28.28 
 
 		 434 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  28.28 
 
 		 434 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  28.28 
 
 		 434 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  28.28 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  28.44 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  29.83 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  28.89 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33.33 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.71 
 
 		 435 aa  156  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.35 
 
 		 432 aa  155  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  28.05 
 
 		 434 aa  156  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  28.05 
 
 		 434 aa  156  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  27.93 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  28.47 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  31.03 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  31.03 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  28.24 
 
 		 495 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  27.82 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  29.21 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  29.21 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  29.73 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  29.44 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  29.21 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.6 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  27.99 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  29.22 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  29.86 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.9 
 
 		 426 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  27.36 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  28.7 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  30.71 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  28.47 
 
 		 513 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.03 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  30.1 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  30.2 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  30.81 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.19 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.5 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  27.25 
 
 		 485 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>