More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0224 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0186  trigger factor  98.42 
 
 
444 aa  852    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  100 
 
 
444 aa  867    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  74.41 
 
 
439 aa  642    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1498  trigger factor  61.83 
 
 
441 aa  536  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  60.89 
 
 
443 aa  527  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  60.8 
 
 
435 aa  518  1e-146  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  59 
 
 
437 aa  509  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  50.59 
 
 
431 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  42.89 
 
 
433 aa  351  1e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  34.22 
 
 
436 aa  202  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  29.77 
 
 
448 aa  193  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  32.01 
 
 
445 aa  193  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  31.53 
 
 
447 aa  189  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  31.28 
 
 
447 aa  187  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  33.09 
 
 
439 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  36.53 
 
 
428 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  31.4 
 
 
435 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  34.81 
 
 
428 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  31.81 
 
 
444 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.95 
 
 
435 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.98 
 
 
434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.99 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  30.05 
 
 
434 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  29.9 
 
 
434 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  30.83 
 
 
441 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  32.11 
 
 
512 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.56 
 
 
429 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  31.54 
 
 
434 aa  170  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  28.6 
 
 
435 aa  169  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.49 
 
 
433 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  29.41 
 
 
434 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.64 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.8 
 
 
434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  30.64 
 
 
436 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  27.67 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  29.73 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  31.42 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  29.73 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  29.73 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  29.73 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  29.73 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  29.73 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  30.24 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  29.73 
 
 
432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  31.71 
 
 
544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  29.83 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  29.73 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  29.73 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1678  trigger factor  30.48 
 
 
432 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  32.8 
 
 
433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  30.39 
 
 
436 aa  163  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  29.38 
 
 
432 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  29.38 
 
 
432 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  29.61 
 
 
432 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  29.61 
 
 
432 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  29.61 
 
 
432 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.82 
 
 
427 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  29.25 
 
 
432 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.72 
 
 
436 aa  162  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  30.79 
 
 
443 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  30.53 
 
 
443 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  29.79 
 
 
436 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  29.79 
 
 
436 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  32.64 
 
 
513 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  31.35 
 
 
436 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  29.71 
 
 
434 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  29.53 
 
 
436 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  30.07 
 
 
435 aa  160  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  27.92 
 
 
435 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.41 
 
 
425 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  31.81 
 
 
472 aa  159  1e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  32.13 
 
 
473 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  28.5 
 
 
434 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  31.96 
 
 
443 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  32.75 
 
 
459 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.21 
 
 
433 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  29.73 
 
 
434 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  28.34 
 
 
436 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  29.06 
 
 
434 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  28.99 
 
 
434 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  29.06 
 
 
434 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  29.06 
 
 
434 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  29.56 
 
 
551 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  30.64 
 
 
438 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  32.53 
 
 
433 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  32.53 
 
 
433 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.93 
 
 
425 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.51 
 
 
442 aa  156  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  27.84 
 
 
436 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  28.33 
 
 
434 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  27.84 
 
 
436 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  28.47 
 
 
432 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>