More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1498 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1498  trigger factor  100 
 
 		 441 aa  872    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  80.37 
 
 		 443 aa  706    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  66.44 
 
 		 435 aa  579  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  62.3 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  61.83 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  61.36 
 
 		 439 aa  527  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  59.13 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  51.05 
 
 		 431 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  40.55 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  31.67 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  32.2 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  31.71 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  36.1 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  31.09 
 
 		 439 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.15 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  34.91 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  32.3 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  31.67 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  35.39 
 
 		 425 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  34.58 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  29.71 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  34.58 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  34.58 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  34.58 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  34.58 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  34.58 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  34.58 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  31.22 
 
 		 512 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.58 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  34.58 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  34.58 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.44 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  31.82 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  30.02 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  30.02 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  30.02 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  30.02 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  30.02 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  30.02 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  30.02 
 
 		 432 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  30.02 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  27.71 
 
 		 436 aa  163  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  27.68 
 
 		 433 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.23 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  30.65 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  30.02 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  29.79 
 
 		 432 aa  161  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  30.2 
 
 		 485 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  28.96 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  29.41 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  26.76 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.83 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  26.53 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  32.12 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  28.18 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  28.6 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  29.33 
 
 		 432 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  29.33 
 
 		 432 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  29.33 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  29.33 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.01 
 
 		 435 aa  156  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  29.33 
 
 		 432 aa  156  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  28.67 
 
 		 434 aa  156  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  29.54 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  32.2 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  28.28 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  28.51 
 
 		 435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  31.53 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  38.78 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.66 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  29.02 
 
 		 476 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  29.33 
 
 		 435 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  28.79 
 
 		 442 aa  153  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  27.87 
 
 		 434 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  30.67 
 
 		 435 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  29.64 
 
 		 544 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.12 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  27.83 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  27.83 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  27.83 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.32 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  29.74 
 
 		 430 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  31.9 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  31.39 
 
 		 478 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  31.39 
 
 		 478 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  27.31 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  28.7 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  31.14 
 
 		 478 aa  149  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  30.83 
 
 		 443 aa  149  7e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.48 
 
 		 432 aa  149  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  29.89 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  28.73 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  29.97 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  27.25 
 
 		 432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  31.38 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  31.38 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  29.26 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  27.76 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  29.48 
 
 		 513 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30.79 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>