More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2037 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  100 
 
 		 433 aa  861    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  45.09 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  43.59 
 
 		 444 aa  356  5e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  42.89 
 
 		 444 aa  351  1e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  42.29 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  44.13 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  39.58 
 
 		 435 aa  332  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1498  trigger factor  40.98 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  38.69 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  32.33 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  33.33 
 
 		 439 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  31.96 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  30.93 
 
 		 447 aa  193  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  31.74 
 
 		 435 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  30.93 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.55 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  30.28 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  31.51 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  33.25 
 
 		 513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.99 
 
 		 425 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.73 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  34.11 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  33.18 
 
 		 459 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.25 
 
 		 425 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.25 
 
 		 425 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.25 
 
 		 425 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.25 
 
 		 425 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.25 
 
 		 425 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.25 
 
 		 425 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.6 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.99 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  30.5 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  29.98 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.73 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  29.82 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.73 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  31.77 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  30.81 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  33.33 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  33.33 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  34.16 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  32.27 
 
 		 473 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  33.83 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  30.56 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  30.37 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.03 
 
 		 436 aa  173  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  28.24 
 
 		 433 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  32.72 
 
 		 443 aa  172  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  29.74 
 
 		 437 aa  172  9e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  34.39 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  32.69 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  30.83 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  30.26 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  29.4 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  31.7 
 
 		 544 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  29.38 
 
 		 435 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  29.4 
 
 		 512 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.49 
 
 		 429 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  29.98 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  29.1 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  32.04 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  29.36 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  29.55 
 
 		 452 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  33.24 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  32.05 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  29.77 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  32.17 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  29.77 
 
 		 478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  30.71 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  29.26 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  29.77 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.39 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  34.75 
 
 		 442 aa  162  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  29.06 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  27.56 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  25.74 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  32.9 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  29.32 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  30 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.49 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  25.47 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  31.33 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  28.06 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  29.34 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  30.05 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  28.02 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  31.12 
 
 		 434 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28.31 
 
 		 448 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  28.31 
 
 		 474 aa  156  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  30.38 
 
 		 432 aa  156  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.08 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  30.75 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  30.75 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  27.65 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  28.97 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  32.45 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  29.7 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  30.73 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  29.68 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.99 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>