More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1693 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  100 
 
 
435 aa  858    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1498  trigger factor  66.98 
 
 
441 aa  578  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  62.99 
 
 
437 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  65.34 
 
 
443 aa  568  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  60.8 
 
 
444 aa  519  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  60.8 
 
 
444 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  59.62 
 
 
439 aa  509  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  51.97 
 
 
431 aa  450  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  39.58 
 
 
433 aa  332  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  34.25 
 
 
429 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  30.91 
 
 
445 aa  189  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  37.14 
 
 
428 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  31.24 
 
 
447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  30.56 
 
 
447 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  30.68 
 
 
494 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  30.86 
 
 
485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  31.77 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  34.02 
 
 
512 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  33.91 
 
 
428 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  30.79 
 
 
485 aa  180  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28.73 
 
 
448 aa  179  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  31.24 
 
 
485 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  35.64 
 
 
427 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  33.07 
 
 
436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  30.72 
 
 
426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  30.24 
 
 
495 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  32.23 
 
 
444 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  34.25 
 
 
425 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  34.25 
 
 
425 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  34.25 
 
 
425 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  34.25 
 
 
425 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  34.25 
 
 
425 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  29.77 
 
 
491 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  34.25 
 
 
425 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  28.87 
 
 
476 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  34.25 
 
 
425 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.79 
 
 
425 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.79 
 
 
425 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  28.94 
 
 
473 aa  169  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  29.01 
 
 
544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.08 
 
 
435 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  32.61 
 
 
472 aa  167  5e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  33.33 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  29.07 
 
 
452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  30.02 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  33.7 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  30.99 
 
 
435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1900  trigger factor  28.89 
 
 
453 aa  163  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.958008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  34.28 
 
 
444 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  34.28 
 
 
444 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  30.11 
 
 
441 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  29.36 
 
 
435 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  32.83 
 
 
430 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  32.12 
 
 
443 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.61 
 
 
433 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  32.88 
 
 
424 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  30.94 
 
 
439 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.33 
 
 
434 aa  160  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  29.38 
 
 
551 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  30.24 
 
 
434 aa  160  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.89 
 
 
438 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1349  trigger factor  31.77 
 
 
444 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295342  normal  0.310757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  31.88 
 
 
433 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  27.29 
 
 
436 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  27.13 
 
 
474 aa  157  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  33.01 
 
 
432 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  29.62 
 
 
478 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  29.38 
 
 
478 aa  156  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  29.38 
 
 
478 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  29.23 
 
 
460 aa  156  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  32.79 
 
 
433 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  32.79 
 
 
433 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  30.93 
 
 
428 aa  155  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  30.95 
 
 
441 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  29.63 
 
 
518 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  31.79 
 
 
427 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  30.48 
 
 
434 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.04 
 
 
436 aa  154  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  31.59 
 
 
459 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  28.74 
 
 
473 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  154  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  154  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  29.06 
 
 
432 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.23 
 
 
434 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  30.29 
 
 
431 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  28.82 
 
 
432 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  27.76 
 
 
485 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  27.55 
 
 
433 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  27.32 
 
 
463 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  30.12 
 
 
442 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  29.06 
 
 
432 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>