More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0354 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  100 
 
 
472 aa  948    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.43 
 
 
426 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.65 
 
 
429 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.16 
 
 
436 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  31.64 
 
 
428 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.83 
 
 
428 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.68 
 
 
435 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0517  trigger factor  32.07 
 
 
428 aa  186  7e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  28.81 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.27 
 
 
427 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  30.4 
 
 
474 aa  179  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  30.24 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  30.24 
 
 
425 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  30.02 
 
 
438 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2185  trigger factor  31.4 
 
 
460 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.368629  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30 
 
 
425 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  29.66 
 
 
512 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  31.51 
 
 
473 aa  177  3e-43  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  30 
 
 
425 aa  177  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  30 
 
 
425 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  30 
 
 
425 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  30 
 
 
425 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  30 
 
 
425 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  30 
 
 
425 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  30.24 
 
 
425 aa  176  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.5 
 
 
428 aa  176  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  31.45 
 
 
428 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  31.98 
 
 
438 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  29.25 
 
 
446 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  27.55 
 
 
426 aa  170  4e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  30.91 
 
 
428 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  32.07 
 
 
439 aa  169  7e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  29.17 
 
 
478 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  29.17 
 
 
478 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  29.17 
 
 
478 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7404  trigger factor  29.06 
 
 
473 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  28.95 
 
 
433 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  28.41 
 
 
491 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  28.95 
 
 
433 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30.42 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  29.97 
 
 
439 aa  167  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  32.61 
 
 
435 aa  167  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  27.17 
 
 
428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  29.52 
 
 
427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  25.93 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  28.95 
 
 
442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4575  trigger factor  30.05 
 
 
452 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136212  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  27.55 
 
 
435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.13 
 
 
427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  29.22 
 
 
449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.4 
 
 
433 aa  163  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  30.27 
 
 
431 aa  163  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  29.44 
 
 
452 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  29.08 
 
 
452 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  29.75 
 
 
518 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0016  trigger factor  29.18 
 
 
437 aa  160  3e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  27.8 
 
 
428 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5133  trigger factor  28.7 
 
 
473 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.69039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  27.92 
 
 
485 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  31.54 
 
 
444 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  31.81 
 
 
444 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  28.34 
 
 
494 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  28.74 
 
 
427 aa  158  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.39 
 
 
488 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  29.67 
 
 
451 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  27.05 
 
 
462 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  24.67 
 
 
446 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  28.74 
 
 
431 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  29.61 
 
 
448 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  27.05 
 
 
485 aa  154  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0895  trigger factor  26.82 
 
 
485 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3310  trigger factor  28.23 
 
 
452 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  29.45 
 
 
435 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  28.81 
 
 
493 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.17 
 
 
435 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  26.56 
 
 
440 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.28 
 
 
463 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  27.17 
 
 
495 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1780  trigger factor  29.71 
 
 
443 aa  152  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  30.6 
 
 
551 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  26.39 
 
 
453 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  27.75 
 
 
476 aa  150  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0898  trigger factor  27.52 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2895  trigger factor  28.5 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.590231  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  27.74 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  27.34 
 
 
445 aa  147  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  30.57 
 
 
433 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  27.69 
 
 
433 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  28.43 
 
 
447 aa  144  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  26.98 
 
 
437 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  26.21 
 
 
424 aa  144  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  29.55 
 
 
431 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  28.19 
 
 
513 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  26.76 
 
 
430 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  28.43 
 
 
447 aa  144  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  28.22 
 
 
441 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2190  trigger factor  26.98 
 
 
442 aa  143  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  26.71 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  29.87 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  29.87 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>