More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0882 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  100 
 
 		 449 aa  892    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  74.82 
 
 		 459 aa  651    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  48.65 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  47.93 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  46.64 
 
 		 455 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  48.12 
 
 		 470 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  47.09 
 
 		 469 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  45.12 
 
 		 464 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  42.76 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  44.73 
 
 		 469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  39.95 
 
 		 454 aa  338  8e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  42.43 
 
 		 471 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  44.57 
 
 		 519 aa  326  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  41.18 
 
 		 461 aa  316  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  38.28 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  39.46 
 
 		 454 aa  296  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  41.19 
 
 		 463 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  41.47 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  38.26 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  38.83 
 
 		 481 aa  289  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  37.74 
 
 		 513 aa  288  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  40.13 
 
 		 463 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  40.95 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  37.81 
 
 		 448 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  37.25 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  35.83 
 
 		 491 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  38.75 
 
 		 468 aa  272  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  38.78 
 
 		 473 aa  272  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  38.01 
 
 		 479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  37.13 
 
 		 507 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  37.59 
 
 		 483 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  36.82 
 
 		 465 aa  266  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  38.27 
 
 		 478 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  38.27 
 
 		 478 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  38.27 
 
 		 482 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  36.28 
 
 		 466 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  36.28 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  36.1 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  32.18 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.18 
 
 		 438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.98 
 
 		 429 aa  177  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  28.27 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  31.61 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.07 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.5 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.5 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.9 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.12 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  30.75 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  32.24 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.87 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.87 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.87 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.87 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.87 
 
 		 425 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  31.87 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  28.39 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.59 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  32.12 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.21 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  30.5 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  31.07 
 
 		 478 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.21 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  28.11 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  26.71 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.14 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.14 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  28.13 
 
 		 488 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  31.27 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  30.96 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.96 
 
 		 428 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.55 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  27.66 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  28.94 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.94 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  29.43 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  30.57 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  28.57 
 
 		 435 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  29.72 
 
 		 449 aa  140  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  29.46 
 
 		 427 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  27.59 
 
 		 479 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  27.21 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  28.88 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  26.2 
 
 		 469 aa  136  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  26.92 
 
 		 472 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  27.76 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  26.2 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  25.66 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  29.43 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  26.67 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  28.3 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  29.25 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  29.25 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  29.25 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  29.25 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  26.02 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  27.47 
 
 		 477 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  28.21 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  26.76 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  28.03 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>