More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  100 
 
 		 519 aa  1009    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  56.54 
 
 		 449 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  52.78 
 
 		 460 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  52.12 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  52 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  48.54 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  51.79 
 
 		 469 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  50.82 
 
 		 464 aa  422  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  54.18 
 
 		 455 aa  420  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  50.59 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  48.94 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  44.55 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  45 
 
 		 454 aa  363  6e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  43.49 
 
 		 479 aa  360  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  44.29 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  46.57 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  44.65 
 
 		 466 aa  345  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  44.23 
 
 		 473 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  43.96 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  44.52 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  44.57 
 
 		 449 aa  338  9.999999999999999e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  46.75 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  44.75 
 
 		 482 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  44.75 
 
 		 478 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  44.75 
 
 		 478 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  43.28 
 
 		 513 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  42.2 
 
 		 481 aa  333  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  40.77 
 
 		 491 aa  330  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  42.69 
 
 		 468 aa  329  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  42.33 
 
 		 463 aa  329  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  42.66 
 
 		 483 aa  329  7e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  40.58 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  40.62 
 
 		 448 aa  325  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  40.41 
 
 		 465 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  41.76 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  42.24 
 
 		 463 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  38.5 
 
 		 449 aa  301  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  40.32 
 
 		 458 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  32.48 
 
 		 488 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  31.78 
 
 		 429 aa  194  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  28.11 
 
 		 438 aa  176  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.44 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  29.03 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  31.7 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.4 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.4 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  30.16 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  30.77 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  30.79 
 
 		 425 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  30.79 
 
 		 425 aa  163  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  30.79 
 
 		 478 aa  163  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  30.54 
 
 		 427 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  30.07 
 
 		 425 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  29.84 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  29.84 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  29.84 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  29.84 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  29.84 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  29.84 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  29.95 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  28.27 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  28.34 
 
 		 435 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.74 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  29.38 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  28.64 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.44 
 
 		 436 aa  152  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  29.19 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.68 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  27.15 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  27.46 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  28.37 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  30.35 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  29.73 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  33.84 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  27.5 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  29.72 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  29.35 
 
 		 435 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  31.61 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  31.82 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  28.17 
 
 		 436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  25.87 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0594  trigger factor  29.71 
 
 		 551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  29.71 
 
 		 455 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  29.71 
 
 		 455 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  30.91 
 
 		 428 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  31.29 
 
 		 431 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  26.64 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  30.6 
 
 		 428 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  27.94 
 
 		 437 aa  140  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  27.33 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  27.19 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  26.77 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  29.93 
 
 		 474 aa  138  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  29.33 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  31.95 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  31.8 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  29.31 
 
 		 436 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  28.29 
 
 		 438 aa  136  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  26.68 
 
 		 433 aa  136  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  27.76 
 
 		 436 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>