More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4984 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  100 
 
 		 448 aa  891    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  34.76 
 
 		 435 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  32.88 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  35.2 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  35.2 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  35.39 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  29.56 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  34.5 
 
 		 429 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  30.63 
 
 		 433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  30.54 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  28.41 
 
 		 437 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  27.6 
 
 		 431 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  30.81 
 
 		 437 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  28.05 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  30.47 
 
 		 429 aa  189  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  33.03 
 
 		 438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  27.49 
 
 		 443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.03 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  28.91 
 
 		 446 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  28.41 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  28.8 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  27.83 
 
 		 433 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  27.19 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  27.01 
 
 		 435 aa  163  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  28.42 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  28.8 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  26.76 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  27.51 
 
 		 432 aa  160  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  27.58 
 
 		 471 aa  159  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  26.56 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  29.26 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  27.56 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  27.59 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  26.95 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  29.52 
 
 		 488 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  28.44 
 
 		 460 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  28.4 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  29.23 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  29.32 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  25.12 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  25.51 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.13 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  25.35 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  28.44 
 
 		 500 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  25.69 
 
 		 444 aa  149  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  26.94 
 
 		 454 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  29.25 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  26.7 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  26.24 
 
 		 435 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  24.14 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  27.66 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  23.91 
 
 		 447 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  27.91 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  26.74 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  26.74 
 
 		 433 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  26.52 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  27.5 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  27.67 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  29.22 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  28.44 
 
 		 449 aa  144  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  28.07 
 
 		 427 aa  143  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  26.42 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  25.8 
 
 		 448 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  27.36 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  26.96 
 
 		 447 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.39 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  26.42 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  25.64 
 
 		 465 aa  140  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  25.06 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  27.71 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  25.52 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  26.11 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  26.11 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  27.63 
 
 		 507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  28.41 
 
 		 468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  24.72 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  25.29 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  25.29 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  24.83 
 
 		 438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  27.4 
 
 		 471 aa  136  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  26.65 
 
 		 425 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  28.35 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  28.47 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  25.11 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  28.47 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  25.87 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  26.42 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  26.42 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  26.42 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  26.42 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  26.42 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  25.96 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  26.42 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  26.98 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  25.64 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  25.06 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  25.06 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  25.06 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  25.06 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  24.94 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>