More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2406 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2406  trigger factor  100 
 
 		 450 aa  885    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2189  trigger factor  33.8 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.981322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1954  trigger factor  31.06 
 
 		 428 aa  186  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.657393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0238  trigger factor  31.58 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2137  trigger factor  30.7 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2564  trigger factor domain  29.07 
 
 		 426 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2292  trigger factor  30.45 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0272  trigger factor  28.47 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  26.09 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  28.64 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  26.48 
 
 		 436 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  24.65 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  25 
 
 		 436 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  26.3 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  28.13 
 
 		 435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  26.19 
 
 		 512 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  25.27 
 
 		 437 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  23.95 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  24.77 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  24.62 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  25.22 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  25 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  27.98 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  27.98 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  24.54 
 
 		 436 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  26.2 
 
 		 440 aa  113  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  26.57 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  25.4 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  24.54 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4370  trigger factor  26.33 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345895  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  24.07 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  24.12 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2370  trigger factor  26.32 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  24.54 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  24.48 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2678  trigger factor  26.09 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.981646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2415  trigger factor  26.09 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.09 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3590  trigger factor  26.44 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0497135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  24.31 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  27.95 
 
 		 450 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  23.97 
 
 		 434 aa  109  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  26.8 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  27.85 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2478  trigger factor  25.47 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.656979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  24.48 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  28.41 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  23.92 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  27.85 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  23.13 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  25.6 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  27.88 
 
 		 479 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  23.92 
 
 		 432 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1678  trigger factor  25.74 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  22.72 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  25.87 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  23.73 
 
 		 432 aa  106  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  22.66 
 
 		 494 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  24.41 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  25.5 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  23.84 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  25.5 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  26.04 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1127  trigger factor  26.04 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.252568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  25.23 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2029  trigger factor  24.23 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184706  normal  0.0504057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1208  trigger factor  26.04 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.774051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  23.9 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  26.51 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  26.43 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  24.89 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  25.4 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2958  trigger factor  25.53 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00137272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  23.84 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  23.35 
 
 		 435 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  24.88 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  25 
 
 		 448 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  27.97 
 
 		 466 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  25.52 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  25.17 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  26.85 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  25.17 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  26.99 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  25.17 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  23.49 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  23.46 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  24.14 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1710  trigger factor  24.55 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  0.0467647 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  27.93 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  23.36 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  25.45 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  22.97 
 
 		 474 aa  100  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  25.8 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  25.68 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  24.94 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  23.92 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  22.66 
 
 		 491 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  26.48 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2562  trigger factor  23.97 
 
 		 452 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  26.46 
 
 		 454 aa  99.8  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>