More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0234 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0236  trigger factor domain-containing protein  100 
 
 		 425 aa  812    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0234  trigger factor domain-containing protein  100 
 
 		 425 aa  812    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0632547  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0983  trigger factor domain-containing protein  42.96 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1108  trigger factor domain-containing protein  43.88 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00276647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1708  trigger factor domain-containing protein  36.08 
 
 		 460 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  29 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.06 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  28.15 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  27.03 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  27.17 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  29.8 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.71 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  28.17 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  26.91 
 
 		 433 aa  118  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  27.93 
 
 		 438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  27.44 
 
 		 449 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  27.87 
 
 		 427 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.21 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  26.61 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  26.39 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  26.39 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  27.96 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  27.15 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  25.17 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  27.14 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  26.9 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  26.9 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  26.9 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  26.9 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  26.9 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  26.9 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  27.74 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  25.4 
 
 		 513 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  27.85 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  26.49 
 
 		 425 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  26.49 
 
 		 425 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  26.29 
 
 		 427 aa  96.7  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  26.44 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  26.46 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  24.82 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  26.06 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  25.77 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  26.63 
 
 		 433 aa  93.6  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  26.26 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  25.52 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  24.24 
 
 		 464 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  25.62 
 
 		 465 aa  89.7  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  23.89 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  25.59 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  27.59 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  24.02 
 
 		 460 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  25.51 
 
 		 507 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  24.83 
 
 		 447 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  24.25 
 
 		 449 aa  86.7  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  24.52 
 
 		 448 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  24.94 
 
 		 452 aa  86.7  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  23.26 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  26.02 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  24.01 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  25.4 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  25.06 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  24.42 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  26 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  23.81 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  25.45 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  25.12 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  25.07 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  26.06 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  25.92 
 
 		 481 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  24.86 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  24.32 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  24.86 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  25.35 
 
 		 519 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  24.94 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  25.41 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  25.91 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  26.14 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  24.09 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  26.33 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  24.83 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  25.27 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  27.87 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  25.37 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  24.42 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  25.39 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  26.87 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  26.12 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  22.56 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  24.48 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  25.92 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  22.76 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  24.09 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  27.57 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  23.32 
 
 		 474 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  24.12 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  22.72 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  22.72 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  25.5 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  26.21 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  25.53 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>