More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1477 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  80.25 
 
 		 539 aa  751    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  100 
 
 		 506 aa  1006    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  42.56 
 
 		 484 aa  356  6.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  35.53 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  33.92 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  34.65 
 
 		 427 aa  189  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.6 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.33 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.33 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.33 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.33 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.33 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.33 
 
 		 425 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  30.87 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.03 
 
 		 435 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  29.52 
 
 		 447 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  32.02 
 
 		 427 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.8 
 
 		 425 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  32.53 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  32.53 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.01 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.14 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3885  trigger factor domain-containing protein  40.91 
 
 		 481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000588775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  32.13 
 
 		 426 aa  174  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  29.31 
 
 		 447 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  30.81 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30.93 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  30.77 
 
 		 488 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  30.51 
 
 		 448 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  32.53 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.61 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  28.1 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  30.17 
 
 		 479 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.59 
 
 		 433 aa  163  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  28.02 
 
 		 439 aa  163  8.000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.85 
 
 		 428 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.59 
 
 		 433 aa  163  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  30.62 
 
 		 427 aa  161  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.67 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.27 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  29.79 
 
 		 438 aa  160  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  31.04 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  32.11 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  28.97 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  28.07 
 
 		 447 aa  147  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  28.81 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  28.81 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  28.54 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  27.75 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  28.93 
 
 		 469 aa  143  6e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.21 
 
 		 435 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  28.13 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  35.52 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  27.37 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  28.97 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  29.93 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  27.18 
 
 		 479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  28.95 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  26.39 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  32.3 
 
 		 430 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  28.5 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  27.09 
 
 		 500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  26.32 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  28.82 
 
 		 481 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  24.44 
 
 		 436 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  28.22 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  25.38 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  27.3 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  29.7 
 
 		 450 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  27.32 
 
 		 468 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  27.95 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  28.68 
 
 		 454 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  27.73 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  26.85 
 
 		 434 aa  127  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  28.39 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  26 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  27.79 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  29.75 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  26.93 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  30.34 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.59 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  30.34 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  29.06 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  29.95 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  30.34 
 
 		 429 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  27.82 
 
 		 435 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  29.46 
 
 		 479 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  27.85 
 
 		 460 aa  123  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  26.85 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  26.75 
 
 		 465 aa  123  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  23.79 
 
 		 431 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  26.34 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  26.34 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  26.34 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  26.84 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  26.34 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  26.34 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  26.84 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  26.84 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  26.6 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>