More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3885 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3885  trigger factor domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  938    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000588775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  41.25 
 
 		 539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  39.21 
 
 		 484 aa  329  6e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  39.87 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  45.14 
 
 		 500 aa  147  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  29.25 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  26.17 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  25.84 
 
 		 428 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  26.77 
 
 		 485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  24.62 
 
 		 428 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  24.66 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  25.44 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  25.17 
 
 		 427 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  23.83 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  24.71 
 
 		 428 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  38.59 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  38.67 
 
 		 426 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  23.17 
 
 		 427 aa  104  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  23.85 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  35 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  24.74 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  23.63 
 
 		 424 aa  103  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  23.06 
 
 		 431 aa  103  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  22.22 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  21.65 
 
 		 479 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  35.03 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  24.77 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  22.47 
 
 		 440 aa  96.7  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  33.15 
 
 		 447 aa  96.7  9e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  24.66 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000460382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  34.05 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  32.6 
 
 		 438 aa  95.1  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  35.56 
 
 		 446 aa  94.4  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  33.33 
 
 		 447 aa  93.6  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  41.32 
 
 		 435 aa  94  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  24.18 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  26.5 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  37.22 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  25.72 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  25.72 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  25.72 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  24.18 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  22.46 
 
 		 433 aa  90.9  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  24.33 
 
 		 436 aa  90.9  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  22.94 
 
 		 449 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  22.94 
 
 		 449 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  22.94 
 
 		 449 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  22.94 
 
 		 449 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  22.94 
 
 		 449 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  22.94 
 
 		 449 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  22.94 
 
 		 449 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2118  trigger factor  22.71 
 
 		 449 aa  90.1  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  32.04 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  26.29 
 
 		 429 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  25.46 
 
 		 434 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  23.94 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  23.48 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  25.72 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  25.33 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  31.49 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  32.2 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  23.24 
 
 		 448 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  21.78 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  23.24 
 
 		 448 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  22.77 
 
 		 448 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  25.46 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  25.46 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  23 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  23.58 
 
 		 427 aa  87  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  31.64 
 
 		 479 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  22.88 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  23.33 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  24.67 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  33.73 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  23.2 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  33.33 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  31.11 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  21.6 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  32.77 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  24.55 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  24.55 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  27.78 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  34.5 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  35.03 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  19.52 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  25.4 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  33.1 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  22.37 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  36.8 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  36.8 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  30.53 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  27.35 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  35.71 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.2 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  32.2 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  32.2 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  32.2 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  32.2 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  32.2 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  32.2 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>