More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3661 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1477  trigger factor  80.25 
 
 		 506 aa  751    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.571552  normal  0.413399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  100 
 
 		 539 aa  1068    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  44.47 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  37.94 
 
 		 500 aa  239  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3885  trigger factor domain-containing protein  40.91 
 
 		 481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000588775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  33.66 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  33.07 
 
 		 427 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  31.19 
 
 		 436 aa  173  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  31.89 
 
 		 428 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  29.55 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  29.37 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  32.28 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  31.62 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  29.44 
 
 		 447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  32.01 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  32.01 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  32.01 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  32.01 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  32.01 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  32.01 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  31.11 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  30.26 
 
 		 432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  29.49 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  31.1 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  32.99 
 
 		 446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.48 
 
 		 425 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.22 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.22 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  30.08 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  29.25 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  28.09 
 
 		 449 aa  160  7e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.17 
 
 		 438 aa  159  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  29.75 
 
 		 429 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  29.12 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  29.12 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  26.8 
 
 		 428 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  28.16 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  28.25 
 
 		 479 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  30.42 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.65 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  30.93 
 
 		 427 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  29.38 
 
 		 435 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  29.02 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  29.02 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  28.64 
 
 		 435 aa  144  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  27.96 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  28.01 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  28.16 
 
 		 485 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  28.64 
 
 		 431 aa  139  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  26.98 
 
 		 479 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  26.49 
 
 		 439 aa  138  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  27.96 
 
 		 469 aa  137  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  27.51 
 
 		 500 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  25.85 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  25.41 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  26.7 
 
 		 435 aa  130  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  27.14 
 
 		 428 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  28.94 
 
 		 430 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  28.72 
 
 		 461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  28.85 
 
 		 429 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  24.87 
 
 		 443 aa  127  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  25.22 
 
 		 436 aa  127  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  29.23 
 
 		 429 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  29.23 
 
 		 429 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  27.27 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  27.59 
 
 		 468 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  28.86 
 
 		 450 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  27.8 
 
 		 460 aa  123  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  27.65 
 
 		 436 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  27.88 
 
 		 481 aa  123  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  27.66 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  31.91 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  26.98 
 
 		 482 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  29.14 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  26.16 
 
 		 428 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  27.13 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  26.98 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  26.98 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  28.13 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  28.64 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  26.16 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  27.05 
 
 		 434 aa  118  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  27.89 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  26.62 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  24.38 
 
 		 471 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  31.9 
 
 		 471 aa  117  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  23.75 
 
 		 442 aa  117  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  26.01 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  26.93 
 
 		 458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  31.07 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  26.36 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  28.91 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  27.25 
 
 		 435 aa  115  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  25.41 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  26.68 
 
 		 434 aa  114  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  25.87 
 
 		 434 aa  114  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  25.87 
 
 		 434 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  25.87 
 
 		 434 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  26.06 
 
 		 444 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  26.29 
 
 		 435 aa  113  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>