243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0080 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0080  trigger factor  100 
 
 		 433 aa  880    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0356919  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  24.79 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1052  trigger factor  24.74 
 
 		 436 aa  87.4  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  28.03 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  27.96 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  25.5 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  25.06 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  25.26 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0887  trigger factor  26.06 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109425  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  27.67 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  24.73 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  22.91 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3336  trigger factor  23.2 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  26.02 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  28.35 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  23.08 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  26.6 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  26.03 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  25.33 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  25.83 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  26.01 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1854  trigger factor  23.47 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.689753  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  26.23 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  25.33 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  25.33 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  25.33 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  22.7 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1569  trigger factor  24.31 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.681108  normal  0.0237303 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  26.22 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  24.23 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  25.5 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  23.27 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  25.66 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  28.14 
 
 		 466 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  25.35 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  23.5 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09520  trigger factor  23.12 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.301416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  23.71 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1337  trigger factor  24.38 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.270787  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  24.06 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  24.12 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  24.93 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  23.1 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  26.94 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  23.77 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  24.67 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  24.06 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  25.79 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  24.16 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  24.68 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0186  trigger factor  23.71 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  25.52 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  24.35 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1613  trigger factor  24.05 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  24.83 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  22.3 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1033  trigger factor  27.36 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201113 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2157  trigger factor  25.42 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  24.27 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  23.43 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  30.72 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  25.69 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  23.11 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  22.47 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0843  trigger factor  24.01 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.793444  normal  0.0950155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  23.44 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  25 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  23.99 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  24.66 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  20.89 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  23.47 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  22.8 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  25.16 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0224  trigger factor  23.45 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  23.47 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  21.48 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  24.36 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  24.36 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  24.36 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0142  trigger factor  25.17 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  23.47 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  23.47 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1775  trigger factor  25.17 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  22.69 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  23.82 
 
 		 458 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  23.26 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  23.19 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  21.76 
 
 		 513 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  23.15 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  23.15 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  22.66 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  22.66 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  22.66 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  22.66 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  22.66 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  22.4 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0835  trigger factor  23.79 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.45727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  22.66 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  22.27 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  23.82 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>