More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3336 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3336  trigger factor  100 
 
 		 516 aa  1036    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  26.89 
 
 		 437 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  26.23 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  26.4 
 
 		 440 aa  137  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  26.89 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  27.03 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  25.98 
 
 		 433 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  29.95 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  29.93 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1052  trigger factor  25.68 
 
 		 436 aa  127  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0553  trigger factor  24.94 
 
 		 474 aa  126  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  26.37 
 
 		 446 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  24.89 
 
 		 429 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  27.01 
 
 		 448 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  25.74 
 
 		 461 aa  124  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  26.07 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  24.88 
 
 		 448 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  24.83 
 
 		 464 aa  120  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  25 
 
 		 435 aa  120  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  23.82 
 
 		 448 aa  119  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  27.46 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  25.49 
 
 		 465 aa  118  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  24.4 
 
 		 440 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  25.12 
 
 		 447 aa  118  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  25.68 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  22.2 
 
 		 435 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  23.09 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  25.13 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  25.11 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  24.31 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  26.15 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  25.52 
 
 		 432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  23.01 
 
 		 433 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  27.43 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0916  trigger factor  25.64 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  24.72 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  26.91 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  25.5 
 
 		 454 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1790  trigger factor  26.19 
 
 		 476 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1181  trigger factor  27.01 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.176713  normal  0.0554389 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  23.9 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  25.22 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  24.89 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  23.34 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  27.23 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  25.66 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  24.43 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  22.93 
 
 		 443 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  24.83 
 
 		 463 aa  107  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  25.95 
 
 		 463 aa  106  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  25.7 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  25.17 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  24.11 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  24.11 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  26.79 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2478  trigger factor  28.47 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.444634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  25.06 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  25.66 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  22.52 
 
 		 434 aa  103  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1030  trigger factor  26.01 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.553429  hitchhiker  0.0000000130547 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0909  trigger factor  26.01 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  27.4 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  26.53 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1703  trigger factor  25.11 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  25.3 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2912  trigger factor  24.76 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  23.88 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  26.39 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  26.44 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  23.65 
 
 		 428 aa  101  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  23.83 
 
 		 434 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  25.29 
 
 		 473 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  25.58 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  24.66 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3059  trigger factor  26.14 
 
 		 513 aa  100  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.438703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  23.67 
 
 		 433 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  23.06 
 
 		 513 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2280  trigger factor  25.25 
 
 		 485 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24390  trigger factor  26.35 
 
 		 469 aa  99.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  24.59 
 
 		 455 aa  99.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  24.19 
 
 		 434 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02478  trigger factor  23.72 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  23.84 
 
 		 434 aa  98.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1505  trigger factor  25.11 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  23.97 
 
 		 466 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  24.1 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2391  trigger factor  25.32 
 
 		 453 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6582  trigger factor  24.83 
 
 		 485 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0465754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  21.48 
 
 		 435 aa  97.8  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2599  trigger factor  24.7 
 
 		 470 aa  97.8  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  25.19 
 
 		 449 aa  97.4  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  24.49 
 
 		 434 aa  97.4  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  25.93 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  25.93 
 
 		 425 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  23.45 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2849  trigger factor  24.29 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0303006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  23.45 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  23.45 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  21.87 
 
 		 448 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  23.45 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>