122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2402 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2377  2-methylcitrate dehydratase  64.96 
 
 		 478 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2189  2-methylcitrate dehydratase  64.74 
 
 		 478 aa  651    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2126  2-methylcitrate dehydratase  64.96 
 
 		 478 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2112  2-methylcitrate dehydratase  64.53 
 
 		 478 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1768  2-methylcitrate dehydratase  65.7 
 
 		 494 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0512259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  66.88 
 
 		 481 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2349  2-methylcitrate dehydratase  64.74 
 
 		 478 aa  651    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2316  2-methylcitrate dehydratase  64.53 
 
 		 478 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  100 
 
 		 470 aa  956    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2601  2-methylcitrate dehydratase  63.89 
 
 		 484 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141042  decreased coverage  0.0000146252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1572  2-methylcitrate dehydratase  64.1 
 
 		 481 aa  656    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1662  2-methylcitrate dehydratase  65.55 
 
 		 492 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2451  2-methylcitrate dehydratase  64.96 
 
 		 478 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0986896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3009  2-methylcitrate dehydratase  64.74 
 
 		 478 aa  650    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.51966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  66.3 
 
 		 481 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2368  2-methylcitrate dehydratase  64.96 
 
 		 478 aa  655    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3432  2-methylcitrate dehydratase  64.45 
 
 		 494 aa  635    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01192  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4727  2-methylcitrate dehydratase  65.28 
 
 		 494 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1725  2-methylcitrate dehydratase  64.53 
 
 		 478 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2157  2-methylcitrate dehydratase  64.96 
 
 		 478 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1939  2-methylcitrate dehydratase  65.28 
 
 		 494 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.73412  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0799  2-methylcitrate dehydratase  66.88 
 
 		 481 aa  647    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2338  2-methylcitrate dehydratase  64.24 
 
 		 494 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54000  2-methylcitrate dehydratase  64.86 
 
 		 494 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1070  2-methylcitrate dehydratase  65.58 
 
 		 481 aa  631  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.327536  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0923  2-methylcitrate dehydratase  61.54 
 
 		 495 aa  626  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1779  2-methylcitrate dehydratase  64.09 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293801  hitchhiker  0.00426686 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  63.52 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2419  2-methylcitrate dehydratase  64.69 
 
 		 494 aa  624  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00018845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1507  2-methylcitrate dehydratase  65.02 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1162  2-methylcitrate dehydratase  61.32 
 
 		 474 aa  622  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.696099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1032  2-methylcitrate dehydratase  60.9 
 
 		 474 aa  618  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2157  2-methylcitrate dehydratase  63.27 
 
 		 483 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4654  2-methylcitrate dehydratase  63.75 
 
 		 484 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  62.42 
 
 		 483 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3306  2-methylcitrate dehydratase  62.42 
 
 		 483 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.494444 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3822  2-methylcitrate dehydratase  62.63 
 
 		 483 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  61.57 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  61.57 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4438  2-methylcitrate dehydratase  63.27 
 
 		 483 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3929  2-methylcitrate dehydratase  63.27 
 
 		 483 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3599  2-methylcitrate dehydratase  63.27 
 
 		 483 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1486  2-methylcitrate dehydratase  60.65 
 
 		 482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1497  2-methylcitrate dehydratase  60.86 
 
 		 482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  61.78 
 
 		 483 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  60.92 
 
 		 488 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1754  2-methylcitrate dehydratase  61.75 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.723906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  61.97 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1824  2-methylcitrate dehydratase  61.75 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  61.97 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0494  2-methylcitrate dehydratase  61.75 
 
 		 483 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1302  2-methylcitrate dehydratase  59.59 
 
 		 500 aa  596  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1616  2-methylcitrate dehydratase  61.75 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  61.54 
 
 		 483 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  59.87 
 
 		 483 aa  591  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  59.87 
 
 		 483 aa  590  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  59.87 
 
 		 483 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  60.08 
 
 		 483 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  59.87 
 
 		 483 aa  591  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  59.87 
 
 		 483 aa  591  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0405  2-methylcitrate dehydratase  59.66 
 
 		 483 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  59.66 
 
 		 483 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  59.87 
 
 		 483 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  60.08 
 
 		 483 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  59.87 
 
 		 483 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  59.45 
 
 		 483 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1117  2-methylcitrate dehydratase  58.76 
 
 		 500 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  60.17 
 
 		 483 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  60.51 
 
 		 485 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3024  2-methylcitrate dehydratase  61.17 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47858  predicted protein  54.33 
 
 		 539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06639  2-methylcitrate dehydratase (Eurofung)  49.37 
 
 		 635 aa  473  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.738113  normal  0.139435 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  28.26 
 
 		 428 aa  133  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  28.95 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  28.6 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  28.44 
 
 		 435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  29 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  29 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  29 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  29.91 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  29.91 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  29.91 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  29.91 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  28.35 
 
 		 487 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  29.95 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  29.23 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  27.53 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  28.57 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  29.47 
 
 		 521 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  29.27 
 
 		 505 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  28.46 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  28.94 
 
 		 502 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  27.78 
 
 		 506 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  28.93 
 
 		 499 aa  94  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  27.95 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  28.07 
 
 		 505 aa  90.5  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  28.54 
 
 		 508 aa  89  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  28.43 
 
 		 506 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  28.45 
 
 		 502 aa  86.7  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>