247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0820 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  100 
 
 		 457 aa  939    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  52.41 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  51.1 
 
 		 453 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  45.43 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  39.43 
 
 		 435 aa  342  1e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  37.25 
 
 		 487 aa  312  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  37.86 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  37.86 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  37.86 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  37.56 
 
 		 492 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  37.56 
 
 		 492 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  36.78 
 
 		 489 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  37.56 
 
 		 492 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  37.56 
 
 		 492 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  36.75 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  31.6 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  32.89 
 
 		 449 aa  237  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  35.73 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  34.91 
 
 		 499 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  33.26 
 
 		 506 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  33.19 
 
 		 505 aa  199  9e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.74 
 
 		 508 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.04 
 
 		 505 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  33.93 
 
 		 505 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  33.64 
 
 		 502 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  32.1 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  33.26 
 
 		 510 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  33.11 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  32.44 
 
 		 526 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  30.91 
 
 		 499 aa  183  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  32.22 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  33.49 
 
 		 521 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  25.84 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  30.63 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  32 
 
 		 505 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  30.96 
 
 		 528 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  30.66 
 
 		 502 aa  170  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  28.91 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  28.1 
 
 		 450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  28.32 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  29.12 
 
 		 507 aa  152  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  25.99 
 
 		 451 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  28.6 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  27.08 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  26.48 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  28.88 
 
 		 481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  26.13 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25.33 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  27.57 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  26.37 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2157  2-methylcitrate dehydratase  28.54 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  28.48 
 
 		 504 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  29.21 
 
 		 488 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3306  2-methylcitrate dehydratase  29.23 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.494444 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  29.28 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3822  2-methylcitrate dehydratase  29.23 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  23.73 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  25.43 
 
 		 455 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  26.98 
 
 		 449 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3024  2-methylcitrate dehydratase  28.93 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.12 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4654  2-methylcitrate dehydratase  29.27 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  28.49 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  27.39 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  27.39 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  27.39 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1754  2-methylcitrate dehydratase  27.39 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.723906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  27.39 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0494  2-methylcitrate dehydratase  27.39 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  25.27 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1824  2-methylcitrate dehydratase  27.39 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  29.41 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  24.89 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1616  2-methylcitrate dehydratase  27.27 
 
 		 502 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  27.02 
 
 		 465 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  26.48 
 
 		 460 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  28.79 
 
 		 442 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  26.09 
 
 		 458 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  28.51 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  27.41 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  26.32 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  25.23 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  25.11 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  28.09 
 
 		 483 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2112  2-methylcitrate dehydratase  27.53 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3599  2-methylcitrate dehydratase  28.33 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4438  2-methylcitrate dehydratase  28.33 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2316  2-methylcitrate dehydratase  27.53 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3929  2-methylcitrate dehydratase  28.33 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2189  2-methylcitrate dehydratase  27.53 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3009  2-methylcitrate dehydratase  27.53 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.51966 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2349  2-methylcitrate dehydratase  27.53 
 
 		 478 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  25.34 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2368  2-methylcitrate dehydratase  27.53 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2126  2-methylcitrate dehydratase  27.53 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>