244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0780 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  87.42 
 
 		 453 aa  817    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  100 
 
 		 453 aa  929    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  83.44 
 
 		 453 aa  795    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  52.41 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  45.17 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  43.33 
 
 		 435 aa  355  8.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  38.64 
 
 		 491 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  38.64 
 
 		 491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  39.69 
 
 		 489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  38.64 
 
 		 491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  38.78 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  38.78 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  38.78 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  38.78 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  39.2 
 
 		 485 aa  280  5e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  38.18 
 
 		 487 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  33.7 
 
 		 449 aa  259  9e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  31.54 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.05 
 
 		 508 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  33.41 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  34.28 
 
 		 505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.18 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  33.33 
 
 		 499 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  34.97 
 
 		 521 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  33.48 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  33.48 
 
 		 506 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  33.33 
 
 		 505 aa  192  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  32.96 
 
 		 506 aa  192  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  28.95 
 
 		 471 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  31.82 
 
 		 526 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  32.79 
 
 		 499 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  34.03 
 
 		 502 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  32.72 
 
 		 505 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  33.33 
 
 		 510 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  33.09 
 
 		 499 aa  179  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  32.35 
 
 		 528 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  31.8 
 
 		 507 aa  170  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0799  2-methylcitrate dehydratase  29.89 
 
 		 481 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1032  2-methylcitrate dehydratase  30.79 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  30.55 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  30.82 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1162  2-methylcitrate dehydratase  30.11 
 
 		 474 aa  156  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.696099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  24.83 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.04 
 
 		 457 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  29.36 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 449 aa  146  9e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  30.24 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  24.72 
 
 		 521 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  30.17 
 
 		 483 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  30.86 
 
 		 483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  29.45 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2601  2-methylcitrate dehydratase  31.1 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141042  decreased coverage  0.0000146252 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1486  2-methylcitrate dehydratase  31.51 
 
 		 482 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  24.78 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3024  2-methylcitrate dehydratase  29.51 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.91 
 
 		 476 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1497  2-methylcitrate dehydratase  33.03 
 
 		 482 aa  136  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1939  2-methylcitrate dehydratase  28.66 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.73412  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  29.51 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2338  2-methylcitrate dehydratase  28.23 
 
 		 494 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  27.23 
 
 		 455 aa  133  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3432  2-methylcitrate dehydratase  28.23 
 
 		 494 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01192  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  30.46 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.68 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1572  2-methylcitrate dehydratase  29.12 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  25.96 
 
 		 451 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1725  2-methylcitrate dehydratase  30.91 
 
 		 478 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2189  2-methylcitrate dehydratase  30.14 
 
 		 478 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2316  2-methylcitrate dehydratase  30.14 
 
 		 478 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3009  2-methylcitrate dehydratase  30.14 
 
 		 478 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.51966 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2349  2-methylcitrate dehydratase  30.14 
 
 		 478 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2377  2-methylcitrate dehydratase  30.14 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470978  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.23 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2126  2-methylcitrate dehydratase  30.14 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2368  2-methylcitrate dehydratase  30.14 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  29.23 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2157  2-methylcitrate dehydratase  29.86 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2451  2-methylcitrate dehydratase  29.84 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0986896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2112  2-methylcitrate dehydratase  30.83 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  26.86 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1779  2-methylcitrate dehydratase  27.67 
 
 		 494 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293801  hitchhiker  0.00426686 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  26.86 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.83 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  27.68 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1662  2-methylcitrate dehydratase  30.03 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  26.65 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  27.88 
 
 		 472 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  27.68 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  26.86 
 
 		 483 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  27.42 
 
 		 483 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 481 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1302  2-methylcitrate dehydratase  30 
 
 		 500 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1117  2-methylcitrate dehydratase  30 
 
 		 500 aa  126  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  27.68 
 
 		 483 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  27.45 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  27.45 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  27.45 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  27.45 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54000  2-methylcitrate dehydratase  28.5 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4727  2-methylcitrate dehydratase  28.5 
 
 		 494 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.234183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>