245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0625 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  87.42 
 
 		 453 aa  800    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  100 
 
 		 453 aa  929    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  85.43 
 
 		 453 aa  808    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  51.1 
 
 		 457 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  45.84 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  43.78 
 
 		 435 aa  355  6.999999999999999e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  37.95 
 
 		 489 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  36.96 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  36.96 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  36.96 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  37.25 
 
 		 487 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  36.65 
 
 		 492 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  36.65 
 
 		 492 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  36.65 
 
 		 492 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  36.65 
 
 		 492 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  38.44 
 
 		 485 aa  273  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  34.15 
 
 		 449 aa  249  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  30.87 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.33 
 
 		 508 aa  200  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  33.41 
 
 		 505 aa  200  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  33.49 
 
 		 505 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  34 
 
 		 457 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.5 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  32.43 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  32.3 
 
 		 502 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  29.39 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  31.52 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  31.51 
 
 		 506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  32.27 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  31.34 
 
 		 499 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  30.68 
 
 		 526 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  33.73 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  32.24 
 
 		 505 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  33.26 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  31.73 
 
 		 507 aa  173  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  31.29 
 
 		 499 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  30.72 
 
 		 528 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  26.97 
 
 		 456 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0799  2-methylcitrate dehydratase  28.97 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1032  2-methylcitrate dehydratase  31.09 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1162  2-methylcitrate dehydratase  29.69 
 
 		 474 aa  150  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.696099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  29.13 
 
 		 507 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  29.11 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1123  2-methylcitrate dehydratase  28.51 
 
 		 481 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  25.38 
 
 		 521 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.2 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  26.68 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  29.96 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2601  2-methylcitrate dehydratase  32.62 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141042  decreased coverage  0.0000146252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  25.49 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  31.3 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.64 
 
 		 446 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1486  2-methylcitrate dehydratase  30.65 
 
 		 482 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  30.19 
 
 		 458 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  31 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3024  2-methylcitrate dehydratase  29.52 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  29.37 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  29.97 
 
 		 481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1939  2-methylcitrate dehydratase  28.47 
 
 		 494 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.73412  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1725  2-methylcitrate dehydratase  30.1 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.19 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1497  2-methylcitrate dehydratase  29.57 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  29.01 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  26.86 
 
 		 455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  28.96 
 
 		 488 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2338  2-methylcitrate dehydratase  28.02 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25.33 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  26.9 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.55 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3432  2-methylcitrate dehydratase  28.02 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01192  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2112  2-methylcitrate dehydratase  29.37 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  28.24 
 
 		 483 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  28.24 
 
 		 483 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  29.14 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  28.24 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1572  2-methylcitrate dehydratase  28.54 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342813  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2451  2-methylcitrate dehydratase  30.65 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0986896  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  28.24 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  29.65 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  28 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1662  2-methylcitrate dehydratase  30.08 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.414028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  28 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  28 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  25.17 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  27.76 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1779  2-methylcitrate dehydratase  29.41 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293801  hitchhiker  0.00426686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  27.13 
 
 		 483 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2377  2-methylcitrate dehydratase  30.38 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2189  2-methylcitrate dehydratase  29.13 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2349  2-methylcitrate dehydratase  29.13 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2316  2-methylcitrate dehydratase  29.13 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3009  2-methylcitrate dehydratase  29.13 
 
 		 478 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.51966 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  27.76 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2126  2-methylcitrate dehydratase  29.13 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2368  2-methylcitrate dehydratase  29.13 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  27.76 
 
 		 483 aa  123  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2157  2-methylcitrate dehydratase  30.38 
 
 		 478 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.99 
 
 		 481 aa  123  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  27.76 
 
 		 483 aa  123  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>