245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4133 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  100 
 
 		 485 aa  967    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  59 
 
 		 491 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  57.8 
 
 		 489 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  59 
 
 		 491 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  58.58 
 
 		 491 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  58.66 
 
 		 492 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  58.66 
 
 		 492 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  58.66 
 
 		 492 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  60.22 
 
 		 487 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  58.66 
 
 		 492 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  36.75 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  38.44 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  39.2 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  29.89 
 
 		 435 aa  232  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  31.77 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  34.24 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  32.93 
 
 		 457 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  29.67 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.94 
 
 		 508 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  33.11 
 
 		 506 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  34.09 
 
 		 505 aa  180  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.18 
 
 		 505 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  27.79 
 
 		 471 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  32.25 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  31.79 
 
 		 506 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  33.73 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  31.16 
 
 		 526 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  33.67 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  33.42 
 
 		 499 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  29.72 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  33.81 
 
 		 502 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  32.72 
 
 		 528 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  31.03 
 
 		 502 aa  156  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  31.46 
 
 		 510 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  32.58 
 
 		 507 aa  153  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  27.95 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  32.65 
 
 		 521 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  31.12 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  30.5 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  28.74 
 
 		 507 aa  128  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  29.32 
 
 		 460 aa  126  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2695  MmgE/PrpD family protein  28.76 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  33.01 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  29.05 
 
 		 467 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 446 aa  120  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.81 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  28.51 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27.53 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  31.78 
 
 		 488 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  24.45 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.5 
 
 		 458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  28.57 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  27.23 
 
 		 482 aa  113  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  31.04 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  26.68 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  27.57 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.67 
 
 		 470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.35 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  26.5 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  28.76 
 
 		 483 aa  110  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  27.59 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.28 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3822  2-methylcitrate dehydratase  28.48 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.94 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3024  2-methylcitrate dehydratase  28.54 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4654  2-methylcitrate dehydratase  28.41 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  27.4 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  30.28 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  25.34 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  27.15 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  32.05 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  28.67 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.16 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  26.87 
 
 		 481 aa  106  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  26.7 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2157  2-methylcitrate dehydratase  27.31 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  26.81 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  26.7 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  26.7 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  26.87 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00288  2-methylcitrate dehydratase  26.54 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0404  2-methylcitrate dehydratase  26.7 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2402  2-methylcitrate dehydratase  28.57 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.290074  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  27.13 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  25.38 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  28.09 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  28.38 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3272  2-methylcitrate dehydratase  26.32 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0358  2-methylcitrate dehydratase  26.32 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  27.77 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0399  2-methylcitrate dehydratase  26.32 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  27.77 
 
 		 483 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3599  2-methylcitrate dehydratase  27.65 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4438  2-methylcitrate dehydratase  27.65 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3291  2-methylcitrate dehydratase  26.32 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3929  2-methylcitrate dehydratase  27.65 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  27.89 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0365  2-methylcitrate dehydratase  26.1 
 
 		 483 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.756913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>