204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0286 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
481 aa  968    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  42.11 
 
 
470 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  41.76 
 
 
481 aa  329  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  41.24 
 
 
470 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  33.49 
 
 
456 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  32.79 
 
 
449 aa  241  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  31.58 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  31.35 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  31.35 
 
 
446 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  37.55 
 
 
465 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  36.01 
 
 
503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  36.28 
 
 
472 aa  213  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  34.63 
 
 
503 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  34.63 
 
 
503 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  32.75 
 
 
476 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  37.77 
 
 
447 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  39.77 
 
 
468 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  37.56 
 
 
468 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  32.57 
 
 
461 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7945  MmgE/PrpD family protein  37.21 
 
 
465 aa  177  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  31.89 
 
 
461 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  32.52 
 
 
451 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  37.57 
 
 
456 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  34.82 
 
 
455 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  34.5 
 
 
458 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  31.86 
 
 
461 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  36.07 
 
 
454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  35.44 
 
 
457 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.7 
 
 
468 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  28.93 
 
 
455 aa  159  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  35 
 
 
458 aa  153  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  31.9 
 
 
451 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31 
 
 
458 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  30.14 
 
 
463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.22 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  30.33 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  30.97 
 
 
486 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  29.67 
 
 
450 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.58 
 
 
457 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  31.51 
 
 
462 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  35.52 
 
 
447 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  31.41 
 
 
454 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  30.65 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  28.57 
 
 
449 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  31.59 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  26.64 
 
 
474 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  30.73 
 
 
463 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  30.73 
 
 
464 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  29.35 
 
 
449 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  29.64 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  28.88 
 
 
457 aa  137  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.82 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 
462 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  29.45 
 
 
454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  31.66 
 
 
456 aa  133  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  30.48 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  30.33 
 
 
461 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  27.36 
 
 
454 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  27.21 
 
 
488 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  31.65 
 
 
454 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  30.16 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  31.31 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  27.87 
 
 
453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  27.13 
 
 
482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30.15 
 
 
451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  29.07 
 
 
481 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  32.75 
 
 
439 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  30.09 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.21 
 
 
460 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  29.52 
 
 
483 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.51 
 
 
453 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  30.3 
 
 
451 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  30.03 
 
 
457 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  30.21 
 
 
465 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  29.64 
 
 
476 aa  123  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  27.99 
 
 
453 aa  123  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  31.58 
 
 
504 aa  123  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  28.57 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  28.61 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.44 
 
 
453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  29.8 
 
 
451 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  26.83 
 
 
463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  27.61 
 
 
453 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  29.55 
 
 
494 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  27.73 
 
 
450 aa  117  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  30.21 
 
 
451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  26.23 
 
 
449 aa  114  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  27.44 
 
 
458 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  28.18 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  31.04 
 
 
443 aa  113  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  27.25 
 
 
453 aa  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 
359 aa  113  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  29.62 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  27.23 
 
 
460 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  29.48 
 
 
453 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  28.51 
 
 
467 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  25.49 
 
 
490 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  29.31 
 
 
500 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>