245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1723 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  66.33 
 
 		 491 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  995    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  66.94 
 
 		 487 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  66.33 
 
 		 491 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  66.33 
 
 		 491 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  65.79 
 
 		 492 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  65.79 
 
 		 492 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  65.79 
 
 		 492 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  65.79 
 
 		 492 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  59.69 
 
 		 485 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  36.78 
 
 		 457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 453 aa  279  9e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  37.95 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  39.69 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  31.96 
 
 		 435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  35.84 
 
 		 428 aa  236  9e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  31.29 
 
 		 469 aa  229  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  36.39 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  31.26 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  34.82 
 
 		 505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  35.07 
 
 		 499 aa  179  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  32.76 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  32.35 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  32.89 
 
 		 507 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  32.74 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  33.76 
 
 		 506 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  33.03 
 
 		 521 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  32.92 
 
 		 506 aa  170  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.25 
 
 		 508 aa  169  9e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  34.02 
 
 		 505 aa  166  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  27.86 
 
 		 458 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  34.17 
 
 		 505 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  29.34 
 
 		 460 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  32.5 
 
 		 507 aa  158  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  30.87 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  32.02 
 
 		 526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  32.65 
 
 		 499 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  31.12 
 
 		 528 aa  150  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  29.96 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  30.86 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  25.39 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  29.14 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  30.27 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  31.2 
 
 		 451 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  28.33 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  28.81 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  28.07 
 
 		 456 aa  125  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  30.42 
 
 		 483 aa  123  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  25.23 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  29.24 
 
 		 442 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1616  2-methylcitrate dehydratase  29.52 
 
 		 502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1754  2-methylcitrate dehydratase  29 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.723906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  29 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0494  2-methylcitrate dehydratase  29 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  29 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  29 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1824  2-methylcitrate dehydratase  29 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  26.92 
 
 		 483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.77 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.92 
 
 		 453 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  28.27 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  27.37 
 
 		 500 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  29.23 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3822  2-methylcitrate dehydratase  29.84 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  30.22 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2157  2-methylcitrate dehydratase  30.65 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  27.37 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  24.23 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3306  2-methylcitrate dehydratase  30.38 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.494444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4654  2-methylcitrate dehydratase  28.98 
 
 		 484 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0172434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  26.63 
 
 		 483 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  28.21 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1507  2-methylcitrate dehydratase  27.49 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.371923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  29.41 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  29.75 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  26.78 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  29.74 
 
 		 458 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4438  2-methylcitrate dehydratase  29.6 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3599  2-methylcitrate dehydratase  29.6 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3929  2-methylcitrate dehydratase  29.6 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.17 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  25.05 
 
 		 490 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  28.8 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  27.88 
 
 		 481 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  27.31 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.76 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0871  2-methylcitrate dehydratase  26.45 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000221374  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0464  2-methylcitrate dehydratase  25.39 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0004098  hitchhiker  0.00000887617 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0422  2-methylcitrate dehydratase  25.39 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649578  normal  0.0549377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0410  2-methylcitrate dehydratase  25.39 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282165 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  22.84 
 
 		 449 aa  107  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  29.18 
 
 		 483 aa  107  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  30.07 
 
 		 462 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  26.5 
 
 		 481 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0402  2-methylcitrate dehydratase  25.39 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000295232 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.22 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>