172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4633 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  96.22 
 
 
450 aa  863    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  78.03 
 
 
449 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  897    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  65.24 
 
 
457 aa  546  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  63.35 
 
 
454 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  65.46 
 
 
459 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  61.15 
 
 
462 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  62.36 
 
 
494 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  60.4 
 
 
463 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  60.4 
 
 
464 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  61.02 
 
 
461 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  58.89 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  60.9 
 
 
460 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  60.5 
 
 
454 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  59.37 
 
 
454 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  57.08 
 
 
462 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  60.76 
 
 
476 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  59.14 
 
 
454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  48.43 
 
 
501 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  61.24 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  41.89 
 
 
451 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  35.51 
 
 
449 aa  250  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  36.94 
 
 
442 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  36.29 
 
 
447 aa  217  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.61 
 
 
449 aa  203  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  30.11 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  35.04 
 
 
455 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  29.12 
 
 
446 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  34.98 
 
 
445 aa  196  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 
446 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  34.77 
 
 
443 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  33.8 
 
 
454 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  34.04 
 
 
458 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  33.8 
 
 
457 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  32.39 
 
 
451 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  34.59 
 
 
450 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  32.47 
 
 
456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  34.43 
 
 
453 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  32.22 
 
 
455 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  36.13 
 
 
458 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  29.83 
 
 
456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.53 
 
 
468 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.98 
 
 
488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  32.58 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  29.05 
 
 
453 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  33.71 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  35.25 
 
 
456 aa  163  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  30.43 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 
481 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  34.12 
 
 
470 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  28.51 
 
 
490 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  31.11 
 
 
461 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  30.61 
 
 
463 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  32.47 
 
 
470 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.9 
 
 
458 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  28.1 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  36.89 
 
 
482 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  34.69 
 
 
449 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  29.71 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.92 
 
 
481 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  28.77 
 
 
482 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  34.91 
 
 
467 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.22 
 
 
481 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.84 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  32.47 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  30.46 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  30.4 
 
 
456 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  28.48 
 
 
485 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  30.11 
 
 
471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.1 
 
 
465 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  26.57 
 
 
449 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  31.4 
 
 
476 aa  137  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  33.17 
 
 
503 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  33.17 
 
 
503 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  32.66 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  24.95 
 
 
469 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  28.33 
 
 
489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  30.43 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  28.85 
 
 
450 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  30.46 
 
 
461 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  33.48 
 
 
468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  28.77 
 
 
504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  32.64 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  29.74 
 
 
461 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  30.81 
 
 
471 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  28.77 
 
 
460 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  34.84 
 
 
447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  29.5 
 
 
482 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  32.08 
 
 
462 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 
460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  26.79 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 
450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  32.37 
 
 
454 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  31.67 
 
 
451 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  30.05 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7945  MmgE/PrpD family protein  34.06 
 
 
465 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  31.32 
 
 
472 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  24.56 
 
 
481 aa  116  8.999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  28.29 
 
 
453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>