173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0040 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 453 aa  931    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 485 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  30.77 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  31.91 
 
 		 451 aa  204  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  32.46 
 
 		 454 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  32.48 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.02 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  31.89 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  29.05 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  28.81 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.33 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  29.29 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.98 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  28.96 
 
 		 455 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  31.21 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  27.06 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  35.83 
 
 		 455 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  28.54 
 
 		 449 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  28.94 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  28.94 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  28.9 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  29 
 
 		 462 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  29.17 
 
 		 462 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  28.05 
 
 		 467 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  30.09 
 
 		 465 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  29.09 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  26.37 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27.57 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  28.83 
 
 		 456 aa  146  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  26.98 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  31.5 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  27.66 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  27.89 
 
 		 481 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2639  hypothetical protein  28.07 
 
 		 473 aa  142  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  29.27 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  29.06 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  30.02 
 
 		 454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  26.1 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  28.76 
 
 		 494 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  27.88 
 
 		 470 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  31.9 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.78 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  27.19 
 
 		 482 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  29.79 
 
 		 503 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.65 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  32.01 
 
 		 460 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  25.22 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  27.86 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  27.87 
 
 		 454 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  29.72 
 
 		 503 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  29.72 
 
 		 503 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  27.02 
 
 		 463 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  29.23 
 
 		 468 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  31.31 
 
 		 461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  26.39 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  29.51 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  25.54 
 
 		 446 aa  133  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  28.33 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  26.44 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.95 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  25.76 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  26.45 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  26.45 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  26.57 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  27.9 
 
 		 463 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  26.64 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.18 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  28.33 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  26.67 
 
 		 487 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  27.92 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  27.86 
 
 		 442 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  26.44 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  26.84 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.79 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  29.19 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.14 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  28.63 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  26.87 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  25.22 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  25.87 
 
 		 453 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  25.85 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  27.94 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  26.91 
 
 		 445 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  27.99 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  27 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  27.71 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  28.86 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  27 
 
 		 485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  22.3 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  31.91 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  24.89 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  26.99 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  26.52 
 
 		 471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  30 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  31.59 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>