186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0284 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  100 
 
 
500 aa  1021    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  46.22 
 
 
451 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  47.33 
 
 
453 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  42.27 
 
 
441 aa  307  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  41.82 
 
 
441 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  42.8 
 
 
462 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  36.6 
 
 
453 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  37.2 
 
 
462 aa  219  8.999999999999998e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  33.91 
 
 
455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  35.87 
 
 
457 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  31.69 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  31.86 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  32.07 
 
 
488 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  36.97 
 
 
454 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  32.61 
 
 
482 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  33.59 
 
 
456 aa  194  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  30.99 
 
 
449 aa  193  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  28.12 
 
 
490 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  40.73 
 
 
482 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  33.57 
 
 
483 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  34.29 
 
 
481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  36.04 
 
 
463 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  33.92 
 
 
453 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  35.25 
 
 
465 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  34.27 
 
 
451 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  32.8 
 
 
471 aa  177  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  32.23 
 
 
451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  35.24 
 
 
456 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  32.02 
 
 
461 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  37.5 
 
 
443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  37.35 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  33.69 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  31.25 
 
 
458 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  31 
 
 
456 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  26.55 
 
 
449 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  33.82 
 
 
442 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  28.76 
 
 
446 aa  159  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  32.51 
 
 
450 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.63 
 
 
460 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  37.28 
 
 
442 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  32.27 
 
 
449 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  32.46 
 
 
461 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  32.19 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  31.49 
 
 
460 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  25.88 
 
 
446 aa  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  30.63 
 
 
474 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.12 
 
 
446 aa  150  6e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  29.4 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  31.74 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  32.25 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  31.86 
 
 
451 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  31.38 
 
 
451 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
503 aa  146  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.25 
 
 
450 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  37.27 
 
 
444 aa  144  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  33.85 
 
 
503 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.34 
 
 
470 aa  143  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  33.85 
 
 
503 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  33.84 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  34.95 
 
 
458 aa  140  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  30.21 
 
 
470 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  33.86 
 
 
442 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  26.34 
 
 
469 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.54 
 
 
458 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
477 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.54 
 
 
458 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.76 
 
 
445 aa  137  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  37.37 
 
 
468 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  32.61 
 
 
456 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  31.31 
 
 
461 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.3 
 
 
476 aa  134  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.27 
 
 
465 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  28.78 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  29.18 
 
 
491 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  29.18 
 
 
491 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.2 
 
 
481 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  29.32 
 
 
486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  29.21 
 
 
491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  30.39 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  30.48 
 
 
450 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  32.18 
 
 
468 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.64 
 
 
453 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  29.75 
 
 
492 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  29.75 
 
 
492 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  29.75 
 
 
492 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  29.75 
 
 
492 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  32.39 
 
 
447 aa  123  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  31.87 
 
 
453 aa  123  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  30.89 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  28.44 
 
 
444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  27.8 
 
 
489 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  27.81 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  29.96 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  29.31 
 
 
481 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  27.37 
 
 
485 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  27.68 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  28.48 
 
 
454 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  24.62 
 
 
481 aa  114  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  31.11 
 
 
464 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  27.56 
 
 
457 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>