186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4189 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  100 
 
 		 481 aa  976    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  52.18 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  51.63 
 
 		 470 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  41.76 
 
 		 481 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  32.89 
 
 		 446 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  31.38 
 
 		 446 aa  272  9e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  32.68 
 
 		 449 aa  270  5e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  30.93 
 
 		 446 aa  263  6e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  34.98 
 
 		 456 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  34.43 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  33.48 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7945  MmgE/PrpD family protein  36.46 
 
 		 465 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762062  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  34.38 
 
 		 503 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  33.7 
 
 		 472 aa  206  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  35.8 
 
 		 465 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  33.26 
 
 		 503 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  33.26 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  30.82 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  34.05 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  32.54 
 
 		 456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  33.99 
 
 		 468 aa  181  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  32.89 
 
 		 458 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  33.92 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  38.4 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  34.74 
 
 		 447 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  34.09 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  29.89 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  33.19 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  29.71 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  29.75 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  34.68 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  31.52 
 
 		 460 aa  156  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  28.92 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  34.19 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  29.01 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  28.92 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  30.69 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  28.73 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  30.86 
 
 		 455 aa  146  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.22 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  27.27 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.77 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  29.34 
 
 		 451 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  29.82 
 
 		 441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  28.78 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.34 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  28.91 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  30.77 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  27.97 
 
 		 482 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  32.51 
 
 		 456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  29.13 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  30.63 
 
 		 482 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  27.95 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  29.82 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  29.98 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  29.52 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  27.65 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  26.62 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.36 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  29.18 
 
 		 456 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  29.13 
 
 		 454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  26.76 
 
 		 490 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  27.05 
 
 		 488 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  29.63 
 
 		 462 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  29.86 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  29.86 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  27.06 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.9 
 
 		 449 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  27.94 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  30.04 
 
 		 476 aa  127  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  29.14 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  27.81 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  28.36 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  28.74 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  29.31 
 
 		 467 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  29.38 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  24.3 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  25.94 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  29.8 
 
 		 465 aa  123  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  27.65 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  30.09 
 
 		 494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  25.76 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  27.62 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  28.6 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  29.66 
 
 		 451 aa  120  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  27.65 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  29.2 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  27.88 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  25.38 
 
 		 474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  26.65 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  25.12 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  25.83 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  25.83 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  25.62 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  26.29 
 
 		 487 aa  115  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  24.89 
 
 		 457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  28.08 
 
 		 460 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>