222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6810 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
460 aa  941    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  64.13 
 
 
460 aa  628  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 
455 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  30.87 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  31.31 
 
 
456 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  31.42 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  30.63 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  30.38 
 
 
451 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  28.95 
 
 
469 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  31.49 
 
 
500 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  28.81 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  30.77 
 
 
472 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  29.57 
 
 
481 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 
476 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  27.61 
 
 
463 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  26.41 
 
 
449 aa  150  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.7 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  29.74 
 
 
482 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 
483 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  29.67 
 
 
462 aa  146  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  28.33 
 
 
456 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  29.13 
 
 
485 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  30.52 
 
 
487 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  29.37 
 
 
489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  27.79 
 
 
488 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  28.26 
 
 
472 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  27.82 
 
 
441 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  28.48 
 
 
470 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  29.86 
 
 
451 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  30.16 
 
 
491 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  30.16 
 
 
491 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  30.15 
 
 
458 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  30.16 
 
 
491 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  26.83 
 
 
441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 
458 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  29.63 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  28.81 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  26.78 
 
 
455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  27.88 
 
 
486 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  27.4 
 
 
503 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  27.37 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 
492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 
492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  28.12 
 
 
458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  26.71 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 
492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 
492 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  29.32 
 
 
485 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  27.06 
 
 
449 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  29.53 
 
 
468 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.61 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.98 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  26.48 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24.88 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  27.59 
 
 
457 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  34.18 
 
 
447 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  27.94 
 
 
453 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  29.98 
 
 
461 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  27.46 
 
 
442 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  27.85 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  26.46 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  26.46 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.08 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  30 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  28.47 
 
 
468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  28.68 
 
 
467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  31.26 
 
 
460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  26.73 
 
 
471 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  27.99 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  28.73 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  28.16 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  28.3 
 
 
445 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  27.05 
 
 
461 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  30 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 
453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.23 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  25.21 
 
 
481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  29.16 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  27.56 
 
 
504 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  27.73 
 
 
461 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  28.34 
 
 
456 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  24.34 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  26.62 
 
 
457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 
501 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  28.3 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 
469 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  25.49 
 
 
450 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  24.88 
 
 
451 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  26.18 
 
 
450 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  26.27 
 
 
453 aa  107  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  26.49 
 
 
449 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  27.63 
 
 
458 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  26.98 
 
 
454 aa  104  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  27.17 
 
 
453 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  26.34 
 
 
453 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  27.58 
 
 
463 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  27.58 
 
 
464 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  25.65 
 
 
453 aa  102  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  25.93 
 
 
482 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  27.45 
 
 
449 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>