194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4385 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1027  MmgE/PrpD family protein  85.87 
 
 		 458 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0490086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 521 aa  1069    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  25.88 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  27.95 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  25.39 
 
 		 489 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1275  MmgE/PrpD family protein  25.29 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  25.29 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  25.29 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953  MmgE/PrpD family protein  26.22 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.351953  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0970  MmgE/PrpD family protein  26.22 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1257  MmgE/PrpD family protein  26.22 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2231  MmgE/PrpD family protein  26.22 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  25.38 
 
 		 453 aa  139  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  28.18 
 
 		 428 aa  136  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 453 aa  135  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2001  2-methylcitrate dehydratase  27.99 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  24.72 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0395  2-methylcitrate dehydratase  28.03 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.429073  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  24.87 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  24.56 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  27.43 
 
 		 472 aa  101  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2564  2-methylcitrate dehydratase  28.17 
 
 		 457 aa  93.6  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  26.39 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  29.59 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  23.33 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1656  2-methylcitrate dehydratase  25.84 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11153  hypothetical protein  24.01 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14140  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  24.36 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2478  2-methylcitrate dehydratase  23.35 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.097833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  24.27 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1525  2-methylcitrate dehydratase  23.72 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000828973 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  29.13 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  25.6 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  28.24 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1525  2-methylcitrate dehydratase  24.31 
 
 		 506 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.320923  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0042  2-methylcitrate dehydratase  23.71 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3495  2-methylcitrate dehydratase  23.85 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2512  MmgE/PrpD  22.62 
 
 		 507 aa  79.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  23.7 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  26.46 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  28.95 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2318  2-methylcitrate dehydratase  22.51 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189904  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  22.29 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  25.16 
 
 		 443 aa  76.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2656  2-methylcitrate dehydratase  24.11 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  27.79 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12040  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  22.88 
 
 		 505 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0754559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  26.99 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2207  2-methylcitrate dehydratase  24.03 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.50931  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3512  2-methylcitrate dehydratase  24.15 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  26.09 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  25.42 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0620  2-methylcitrate dehydratase  23.25 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1348  2-methylcitrate dehydratase  22.96 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0107  2-methylcitrate dehydratase  25.38 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149416  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0567  2-methylcitrate dehydratase  24.11 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0655  2-methylcitrate dehydratase  27.01 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.781921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2002  2-methylcitrate dehydratase  27.48 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.213723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  26.59 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2646  2-methylcitrate dehydratase  22.51 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  26.88 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0073  2-methylcitrate dehydratase  26.1 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1616  2-methylcitrate dehydratase  26.11 
 
 		 502 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2477  2-methylcitrate dehydratase  26.11 
 
 		 483 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0799  2-methylcitrate dehydratase  26.11 
 
 		 483 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2339  2-methylcitrate dehydratase  26.11 
 
 		 483 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1754  2-methylcitrate dehydratase  26.11 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.723906  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  25.07 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  22.13 
 
 		 485 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  25.67 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1824  2-methylcitrate dehydratase  26.11 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  24.77 
 
 		 453 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  25.07 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0494  2-methylcitrate dehydratase  26.11 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  24.87 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  26.75 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  25.9 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2902  2-methylcitrate dehydratase  24.21 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  22.48 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4353  2-methylcitrate dehydratase  25.14 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  27.61 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  23.91 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  22.81 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  24.63 
 
 		 462 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  24.23 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  24.71 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3306  2-methylcitrate dehydratase  26.14 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.494444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  27.31 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  23.35 
 
 		 500 aa  62  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6862  2-methylcitrate dehydratase  23.68 
 
 		 483 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.195603  normal  0.185199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  25.08 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  22.98 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0651  2-methylcitrate dehydratase  24.16 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  26.03 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  26.41 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  26.64 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2601  2-methylcitrate dehydratase  24.38 
 
 		 484 aa  60.1  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141042  decreased coverage  0.0000146252 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  25.16 
 
 		 458 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  24.58 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>